Protein–RNA interactions for Protein: Q99217

AMELX, Amelogenin, X isoform, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMELXQ99217 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMELXQ99217 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMELXQ99217 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMELXQ99217 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMELXQ99217 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMELXQ99217 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMELXQ99217 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMELXQ99217 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMELXQ99217 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMELXQ99217 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMELXQ99217 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMELXQ99217 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMELXQ99217 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMELXQ99217 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMELXQ99217 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMELXQ99217 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMELXQ99217 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMELXQ99217 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMELXQ99217 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMELXQ99217 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
AMELXQ99217 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
AMELXQ99217 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMELXQ99217 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms