Protein–RNA interactions for Protein: Q96PR1

KCNC2, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC2Q96PR1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNC2Q96PR1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNC2Q96PR1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNC2Q96PR1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNC2Q96PR1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNC2Q96PR1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNC2Q96PR1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNC2Q96PR1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNC2Q96PR1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNC2Q96PR1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNC2Q96PR1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNC2Q96PR1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNC2Q96PR1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNC2Q96PR1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNC2Q96PR1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNC2Q96PR1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNC2Q96PR1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNC2Q96PR1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNC2Q96PR1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNC2Q96PR1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNC2Q96PR1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNC2Q96PR1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNC2Q96PR1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNC2Q96PR1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNC2Q96PR1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNC2Q96PR1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNC2Q96PR1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNC2Q96PR1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNC2Q96PR1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNC2Q96PR1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNC2Q96PR1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNC2Q96PR1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
KCNC2Q96PR1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNC2Q96PR1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNC2Q96PR1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNC2Q96PR1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNC2Q96PR1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNC2Q96PR1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNC2Q96PR1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNC2Q96PR1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNC2Q96PR1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNC2Q96PR1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNC2Q96PR1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNC2Q96PR1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNC2Q96PR1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNC2Q96PR1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNC2Q96PR1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNC2Q96PR1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNC2Q96PR1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNC2Q96PR1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNC2Q96PR1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNC2Q96PR1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNC2Q96PR1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNC2Q96PR1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNC2Q96PR1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNC2Q96PR1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNC2Q96PR1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNC2Q96PR1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNC2Q96PR1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNC2Q96PR1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNC2Q96PR1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNC2Q96PR1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNC2Q96PR1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNC2Q96PR1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNC2Q96PR1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNC2Q96PR1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNC2Q96PR1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNC2Q96PR1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNC2Q96PR1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNC2Q96PR1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNC2Q96PR1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNC2Q96PR1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNC2Q96PR1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNC2Q96PR1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNC2Q96PR1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNC2Q96PR1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNC2Q96PR1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNC2Q96PR1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNC2Q96PR1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNC2Q96PR1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNC2Q96PR1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNC2Q96PR1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNC2Q96PR1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNC2Q96PR1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNC2Q96PR1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNC2Q96PR1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNC2Q96PR1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNC2Q96PR1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNC2Q96PR1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms