Protein–RNA interactions for Protein: Q96MV1

TMEM56, Transmembrane protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM56Q96MV1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM56Q96MV1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM56Q96MV1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM56Q96MV1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM56Q96MV1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM56Q96MV1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM56Q96MV1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM56Q96MV1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM56Q96MV1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM56Q96MV1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM56Q96MV1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM56Q96MV1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM56Q96MV1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM56Q96MV1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM56Q96MV1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM56Q96MV1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM56Q96MV1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM56Q96MV1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM56Q96MV1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM56Q96MV1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM56Q96MV1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM56Q96MV1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM56Q96MV1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM56Q96MV1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM56Q96MV1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM56Q96MV1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM56Q96MV1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM56Q96MV1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM56Q96MV1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM56Q96MV1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM56Q96MV1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM56Q96MV1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM56Q96MV1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM56Q96MV1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM56Q96MV1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM56Q96MV1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM56Q96MV1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM56Q96MV1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM56Q96MV1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM56Q96MV1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM56Q96MV1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM56Q96MV1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM56Q96MV1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM56Q96MV1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM56Q96MV1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM56Q96MV1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM56Q96MV1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM56Q96MV1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM56Q96MV1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM56Q96MV1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM56Q96MV1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM56Q96MV1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM56Q96MV1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM56Q96MV1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM56Q96MV1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM56Q96MV1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM56Q96MV1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM56Q96MV1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM56Q96MV1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM56Q96MV1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM56Q96MV1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM56Q96MV1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM56Q96MV1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM56Q96MV1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM56Q96MV1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM56Q96MV1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM56Q96MV1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM56Q96MV1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM56Q96MV1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM56Q96MV1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM56Q96MV1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM56Q96MV1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM56Q96MV1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM56Q96MV1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM56Q96MV1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM56Q96MV1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM56Q96MV1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM56Q96MV1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM56Q96MV1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM56Q96MV1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM56Q96MV1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM56Q96MV1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM56Q96MV1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM56Q96MV1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM56Q96MV1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM56Q96MV1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM56Q96MV1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM56Q96MV1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM56Q96MV1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM56Q96MV1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM56Q96MV1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM56Q96MV1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM56Q96MV1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM56Q96MV1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM56Q96MV1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM56Q96MV1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM56Q96MV1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM56Q96MV1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM56Q96MV1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM56Q96MV1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 357.1 ms