Protein–RNA interactions for Protein: Q96LL4

C8orf48, Uncharacterized protein C8orf48, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf48Q96LL4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C8orf48Q96LL4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
C8orf48Q96LL4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C8orf48Q96LL4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C8orf48Q96LL4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
C8orf48Q96LL4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C8orf48Q96LL4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
C8orf48Q96LL4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
C8orf48Q96LL4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C8orf48Q96LL4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C8orf48Q96LL4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C8orf48Q96LL4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C8orf48Q96LL4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C8orf48Q96LL4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C8orf48Q96LL4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C8orf48Q96LL4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C8orf48Q96LL4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C8orf48Q96LL4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C8orf48Q96LL4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C8orf48Q96LL4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.2 ms