Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PGBD1Q96JS3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PGBD1Q96JS3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PGBD1Q96JS3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PGBD1Q96JS3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PGBD1Q96JS3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PGBD1Q96JS3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PGBD1Q96JS3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PGBD1Q96JS3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PGBD1Q96JS3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PGBD1Q96JS3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PGBD1Q96JS3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PGBD1Q96JS3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PGBD1Q96JS3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PGBD1Q96JS3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PGBD1Q96JS3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PGBD1Q96JS3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PGBD1Q96JS3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PGBD1Q96JS3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PGBD1Q96JS3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PGBD1Q96JS3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PGBD1Q96JS3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PGBD1Q96JS3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PGBD1Q96JS3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PGBD1Q96JS3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PGBD1Q96JS3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PGBD1Q96JS3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PGBD1Q96JS3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PGBD1Q96JS3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PGBD1Q96JS3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PGBD1Q96JS3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PGBD1Q96JS3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PGBD1Q96JS3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PGBD1Q96JS3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PGBD1Q96JS3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PGBD1Q96JS3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PGBD1Q96JS3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PGBD1Q96JS3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PGBD1Q96JS3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PGBD1Q96JS3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PGBD1Q96JS3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PGBD1Q96JS3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PGBD1Q96JS3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.4 ms