Protein–RNA interactions for Protein: Q96JE7

SEC16B, Protein transport protein Sec16B, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC16BQ96JE7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC16BQ96JE7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC16BQ96JE7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC16BQ96JE7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC16BQ96JE7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC16BQ96JE7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC16BQ96JE7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC16BQ96JE7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC16BQ96JE7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC16BQ96JE7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC16BQ96JE7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC16BQ96JE7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC16BQ96JE7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC16BQ96JE7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC16BQ96JE7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC16BQ96JE7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC16BQ96JE7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC16BQ96JE7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC16BQ96JE7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC16BQ96JE7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC16BQ96JE7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC16BQ96JE7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC16BQ96JE7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC16BQ96JE7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC16BQ96JE7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC16BQ96JE7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC16BQ96JE7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC16BQ96JE7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC16BQ96JE7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC16BQ96JE7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC16BQ96JE7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC16BQ96JE7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC16BQ96JE7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC16BQ96JE7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC16BQ96JE7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC16BQ96JE7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC16BQ96JE7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC16BQ96JE7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC16BQ96JE7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC16BQ96JE7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC16BQ96JE7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC16BQ96JE7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC16BQ96JE7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC16BQ96JE7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC16BQ96JE7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC16BQ96JE7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC16BQ96JE7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC16BQ96JE7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC16BQ96JE7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC16BQ96JE7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC16BQ96JE7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC16BQ96JE7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC16BQ96JE7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC16BQ96JE7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC16BQ96JE7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC16BQ96JE7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC16BQ96JE7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC16BQ96JE7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC16BQ96JE7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC16BQ96JE7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC16BQ96JE7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC16BQ96JE7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC16BQ96JE7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC16BQ96JE7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC16BQ96JE7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC16BQ96JE7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC16BQ96JE7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC16BQ96JE7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC16BQ96JE7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC16BQ96JE7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC16BQ96JE7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC16BQ96JE7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC16BQ96JE7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC16BQ96JE7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC16BQ96JE7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC16BQ96JE7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC16BQ96JE7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC16BQ96JE7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC16BQ96JE7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC16BQ96JE7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC16BQ96JE7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC16BQ96JE7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC16BQ96JE7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC16BQ96JE7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC16BQ96JE7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC16BQ96JE7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC16BQ96JE7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC16BQ96JE7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC16BQ96JE7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC16BQ96JE7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC16BQ96JE7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC16BQ96JE7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC16BQ96JE7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC16BQ96JE7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC16BQ96JE7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC16BQ96JE7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC16BQ96JE7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC16BQ96JE7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SEC16BQ96JE7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SEC16BQ96JE7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms