Protein–RNA interactions for Protein: Q96B54

ZNF428, Zinc finger protein 428, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF428Q96B54 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ZNF428Q96B54 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZNF428Q96B54 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZNF428Q96B54 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZNF428Q96B54 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ZNF428Q96B54 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZNF428Q96B54 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZNF428Q96B54 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZNF428Q96B54 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZNF428Q96B54 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZNF428Q96B54 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZNF428Q96B54 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZNF428Q96B54 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZNF428Q96B54 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZNF428Q96B54 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZNF428Q96B54 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZNF428Q96B54 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZNF428Q96B54 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZNF428Q96B54 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZNF428Q96B54 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZNF428Q96B54 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZNF428Q96B54 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZNF428Q96B54 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZNF428Q96B54 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZNF428Q96B54 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
ZNF428Q96B54 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZNF428Q96B54 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZNF428Q96B54 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ZNF428Q96B54 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ZNF428Q96B54 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ZNF428Q96B54 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ZNF428Q96B54 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
ZNF428Q96B54 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ZNF428Q96B54 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZNF428Q96B54 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZNF428Q96B54 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZNF428Q96B54 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZNF428Q96B54 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZNF428Q96B54 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZNF428Q96B54 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZNF428Q96B54 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZNF428Q96B54 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZNF428Q96B54 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZNF428Q96B54 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZNF428Q96B54 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZNF428Q96B54 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZNF428Q96B54 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZNF428Q96B54 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZNF428Q96B54 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZNF428Q96B54 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZNF428Q96B54 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZNF428Q96B54 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZNF428Q96B54 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZNF428Q96B54 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZNF428Q96B54 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZNF428Q96B54 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZNF428Q96B54 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZNF428Q96B54 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZNF428Q96B54 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZNF428Q96B54 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZNF428Q96B54 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZNF428Q96B54 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZNF428Q96B54 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZNF428Q96B54 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZNF428Q96B54 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ZNF428Q96B54 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ZNF428Q96B54 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZNF428Q96B54 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZNF428Q96B54 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZNF428Q96B54 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF428Q96B54 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF428Q96B54 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF428Q96B54 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF428Q96B54 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF428Q96B54 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF428Q96B54 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF428Q96B54 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF428Q96B54 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF428Q96B54 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF428Q96B54 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF428Q96B54 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF428Q96B54 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF428Q96B54 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF428Q96B54 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF428Q96B54 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF428Q96B54 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF428Q96B54 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF428Q96B54 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF428Q96B54 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF428Q96B54 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF428Q96B54 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNF428Q96B54 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNF428Q96B54 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNF428Q96B54 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNF428Q96B54 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNF428Q96B54 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNF428Q96B54 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNF428Q96B54 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNF428Q96B54 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF428Q96B54 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms