Protein–RNA interactions for Protein: Q93100

PHKB, Phosphorylase b kinase regulatory subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKBQ93100 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHKBQ93100 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHKBQ93100 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PHKBQ93100 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHKBQ93100 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHKBQ93100 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHKBQ93100 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHKBQ93100 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHKBQ93100 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHKBQ93100 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHKBQ93100 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHKBQ93100 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHKBQ93100 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHKBQ93100 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHKBQ93100 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHKBQ93100 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHKBQ93100 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHKBQ93100 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHKBQ93100 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHKBQ93100 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHKBQ93100 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHKBQ93100 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHKBQ93100 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHKBQ93100 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHKBQ93100 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHKBQ93100 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHKBQ93100 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHKBQ93100 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHKBQ93100 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHKBQ93100 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHKBQ93100 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHKBQ93100 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHKBQ93100 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHKBQ93100 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHKBQ93100 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHKBQ93100 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHKBQ93100 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHKBQ93100 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHKBQ93100 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHKBQ93100 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PHKBQ93100 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PHKBQ93100 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PHKBQ93100 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PHKBQ93100 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PHKBQ93100 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PHKBQ93100 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PHKBQ93100 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
PHKBQ93100 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHKBQ93100 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHKBQ93100 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHKBQ93100 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHKBQ93100 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHKBQ93100 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHKBQ93100 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHKBQ93100 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PHKBQ93100 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHKBQ93100 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHKBQ93100 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHKBQ93100 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHKBQ93100 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHKBQ93100 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHKBQ93100 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHKBQ93100 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHKBQ93100 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHKBQ93100 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHKBQ93100 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHKBQ93100 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHKBQ93100 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHKBQ93100 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHKBQ93100 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHKBQ93100 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHKBQ93100 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHKBQ93100 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHKBQ93100 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHKBQ93100 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHKBQ93100 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHKBQ93100 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHKBQ93100 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHKBQ93100 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PHKBQ93100 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PHKBQ93100 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHKBQ93100 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHKBQ93100 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHKBQ93100 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHKBQ93100 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PHKBQ93100 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
PHKBQ93100 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHKBQ93100 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHKBQ93100 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHKBQ93100 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHKBQ93100 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PHKBQ93100 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHKBQ93100 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHKBQ93100 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHKBQ93100 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHKBQ93100 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHKBQ93100 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHKBQ93100 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHKBQ93100 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHKBQ93100 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms