Protein–RNA interactions for Protein: Q920B9

Supt16h, FACT complex subunit SPT16, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt16hQ920B9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Supt16hQ920B9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Supt16hQ920B9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Supt16hQ920B9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Supt16hQ920B9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Supt16hQ920B9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Supt16hQ920B9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Supt16hQ920B9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Supt16hQ920B9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Supt16hQ920B9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Supt16hQ920B9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Supt16hQ920B9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Supt16hQ920B9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Supt16hQ920B9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Supt16hQ920B9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Supt16hQ920B9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Supt16hQ920B9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Supt16hQ920B9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Supt16hQ920B9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Supt16hQ920B9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Supt16hQ920B9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Supt16hQ920B9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Supt16hQ920B9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Supt16hQ920B9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Supt16hQ920B9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Supt16hQ920B9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Supt16hQ920B9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Supt16hQ920B9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Supt16hQ920B9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Supt16hQ920B9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Supt16hQ920B9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Supt16hQ920B9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Supt16hQ920B9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Supt16hQ920B9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Supt16hQ920B9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Supt16hQ920B9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Supt16hQ920B9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Supt16hQ920B9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Supt16hQ920B9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Supt16hQ920B9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Supt16hQ920B9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Supt16hQ920B9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Supt16hQ920B9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Supt16hQ920B9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Supt16hQ920B9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Supt16hQ920B9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Supt16hQ920B9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Supt16hQ920B9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Supt16hQ920B9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Supt16hQ920B9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Supt16hQ920B9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Supt16hQ920B9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Supt16hQ920B9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Supt16hQ920B9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Supt16hQ920B9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Supt16hQ920B9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Supt16hQ920B9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Supt16hQ920B9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Supt16hQ920B9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Supt16hQ920B9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Supt16hQ920B9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Supt16hQ920B9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Supt16hQ920B9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Supt16hQ920B9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Supt16hQ920B9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Supt16hQ920B9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Supt16hQ920B9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Supt16hQ920B9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Supt16hQ920B9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Supt16hQ920B9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Supt16hQ920B9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Supt16hQ920B9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Supt16hQ920B9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Supt16hQ920B9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Supt16hQ920B9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Supt16hQ920B9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Supt16hQ920B9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Supt16hQ920B9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Supt16hQ920B9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Supt16hQ920B9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Supt16hQ920B9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Supt16hQ920B9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Supt16hQ920B9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Supt16hQ920B9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Supt16hQ920B9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Supt16hQ920B9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Supt16hQ920B9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Supt16hQ920B9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Supt16hQ920B9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Supt16hQ920B9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Supt16hQ920B9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Supt16hQ920B9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Supt16hQ920B9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Supt16hQ920B9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Supt16hQ920B9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Supt16hQ920B9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.68
Supt16hQ920B9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Supt16hQ920B9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Supt16hQ920B9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Supt16hQ920B9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms