Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx15Q91WE1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx15Q91WE1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx15Q91WE1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx15Q91WE1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx15Q91WE1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx15Q91WE1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx15Q91WE1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx15Q91WE1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx15Q91WE1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx15Q91WE1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx15Q91WE1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx15Q91WE1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx15Q91WE1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx15Q91WE1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx15Q91WE1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx15Q91WE1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx15Q91WE1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx15Q91WE1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx15Q91WE1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx15Q91WE1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx15Q91WE1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx15Q91WE1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx15Q91WE1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx15Q91WE1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx15Q91WE1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx15Q91WE1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx15Q91WE1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx15Q91WE1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx15Q91WE1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx15Q91WE1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx15Q91WE1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx15Q91WE1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx15Q91WE1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx15Q91WE1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx15Q91WE1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx15Q91WE1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx15Q91WE1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx15Q91WE1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx15Q91WE1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx15Q91WE1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx15Q91WE1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx15Q91WE1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snx15Q91WE1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snx15Q91WE1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snx15Q91WE1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snx15Q91WE1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx15Q91WE1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx15Q91WE1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx15Q91WE1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx15Q91WE1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx15Q91WE1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx15Q91WE1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx15Q91WE1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx15Q91WE1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx15Q91WE1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx15Q91WE1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx15Q91WE1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx15Q91WE1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx15Q91WE1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx15Q91WE1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx15Q91WE1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx15Q91WE1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx15Q91WE1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx15Q91WE1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx15Q91WE1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx15Q91WE1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx15Q91WE1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx15Q91WE1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx15Q91WE1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx15Q91WE1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx15Q91WE1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx15Q91WE1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx15Q91WE1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx15Q91WE1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx15Q91WE1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx15Q91WE1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx15Q91WE1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snx15Q91WE1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snx15Q91WE1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snx15Q91WE1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snx15Q91WE1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Snx15Q91WE1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snx15Q91WE1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Snx15Q91WE1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snx15Q91WE1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snx15Q91WE1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Snx15Q91WE1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snx15Q91WE1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snx15Q91WE1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snx15Q91WE1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snx15Q91WE1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snx15Q91WE1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snx15Q91WE1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snx15Q91WE1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snx15Q91WE1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snx15Q91WE1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snx15Q91WE1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snx15Q91WE1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snx15Q91WE1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms