Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cabp4Q8VHC5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cabp4Q8VHC5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cabp4Q8VHC5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Cabp4Q8VHC5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cabp4Q8VHC5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cabp4Q8VHC5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cabp4Q8VHC5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cabp4Q8VHC5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Cabp4Q8VHC5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cabp4Q8VHC5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cabp4Q8VHC5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cabp4Q8VHC5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cabp4Q8VHC5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cabp4Q8VHC5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cabp4Q8VHC5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cabp4Q8VHC5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cabp4Q8VHC5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cabp4Q8VHC5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cabp4Q8VHC5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cabp4Q8VHC5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cabp4Q8VHC5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cabp4Q8VHC5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cabp4Q8VHC5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cabp4Q8VHC5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cabp4Q8VHC5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cabp4Q8VHC5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cabp4Q8VHC5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cabp4Q8VHC5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cabp4Q8VHC5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cabp4Q8VHC5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cabp4Q8VHC5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Cabp4Q8VHC5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Cabp4Q8VHC5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cabp4Q8VHC5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cabp4Q8VHC5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cabp4Q8VHC5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cabp4Q8VHC5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cabp4Q8VHC5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cabp4Q8VHC5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cabp4Q8VHC5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cabp4Q8VHC5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cabp4Q8VHC5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cabp4Q8VHC5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cabp4Q8VHC5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cabp4Q8VHC5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cabp4Q8VHC5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cabp4Q8VHC5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cabp4Q8VHC5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cabp4Q8VHC5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cabp4Q8VHC5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cabp4Q8VHC5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cabp4Q8VHC5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Cabp4Q8VHC5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cabp4Q8VHC5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cabp4Q8VHC5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cabp4Q8VHC5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cabp4Q8VHC5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cabp4Q8VHC5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cabp4Q8VHC5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cabp4Q8VHC5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cabp4Q8VHC5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cabp4Q8VHC5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cabp4Q8VHC5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cabp4Q8VHC5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cabp4Q8VHC5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cabp4Q8VHC5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cabp4Q8VHC5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cabp4Q8VHC5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cabp4Q8VHC5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cabp4Q8VHC5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cabp4Q8VHC5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cabp4Q8VHC5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cabp4Q8VHC5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cabp4Q8VHC5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cabp4Q8VHC5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cabp4Q8VHC5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cabp4Q8VHC5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cabp4Q8VHC5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cabp4Q8VHC5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cabp4Q8VHC5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cabp4Q8VHC5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cabp4Q8VHC5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cabp4Q8VHC5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cabp4Q8VHC5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cabp4Q8VHC5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cabp4Q8VHC5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cabp4Q8VHC5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Cabp4Q8VHC5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cabp4Q8VHC5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cabp4Q8VHC5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cabp4Q8VHC5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cabp4Q8VHC5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cabp4Q8VHC5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cabp4Q8VHC5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cabp4Q8VHC5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cabp4Q8VHC5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cabp4Q8VHC5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cabp4Q8VHC5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cabp4Q8VHC5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms