Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB6

DTX3L, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3LQ8TDB6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DTX3LQ8TDB6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DTX3LQ8TDB6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DTX3LQ8TDB6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DTX3LQ8TDB6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DTX3LQ8TDB6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DTX3LQ8TDB6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DTX3LQ8TDB6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DTX3LQ8TDB6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DTX3LQ8TDB6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DTX3LQ8TDB6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DTX3LQ8TDB6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DTX3LQ8TDB6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DTX3LQ8TDB6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DTX3LQ8TDB6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DTX3LQ8TDB6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DTX3LQ8TDB6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DTX3LQ8TDB6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DTX3LQ8TDB6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DTX3LQ8TDB6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DTX3LQ8TDB6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DTX3LQ8TDB6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DTX3LQ8TDB6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DTX3LQ8TDB6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DTX3LQ8TDB6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DTX3LQ8TDB6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DTX3LQ8TDB6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DTX3LQ8TDB6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DTX3LQ8TDB6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DTX3LQ8TDB6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DTX3LQ8TDB6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DTX3LQ8TDB6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DTX3LQ8TDB6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DTX3LQ8TDB6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DTX3LQ8TDB6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DTX3LQ8TDB6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DTX3LQ8TDB6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DTX3LQ8TDB6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DTX3LQ8TDB6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DTX3LQ8TDB6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DTX3LQ8TDB6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DTX3LQ8TDB6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DTX3LQ8TDB6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DTX3LQ8TDB6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DTX3LQ8TDB6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DTX3LQ8TDB6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DTX3LQ8TDB6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DTX3LQ8TDB6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DTX3LQ8TDB6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DTX3LQ8TDB6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DTX3LQ8TDB6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DTX3LQ8TDB6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DTX3LQ8TDB6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DTX3LQ8TDB6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DTX3LQ8TDB6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DTX3LQ8TDB6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
DTX3LQ8TDB6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DTX3LQ8TDB6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DTX3LQ8TDB6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms