Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J3

C17orf53, Uncharacterized protein C17orf53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf53Q8N3J3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
C17orf53Q8N3J3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C17orf53Q8N3J3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C17orf53Q8N3J3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C17orf53Q8N3J3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C17orf53Q8N3J3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C17orf53Q8N3J3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C17orf53Q8N3J3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C17orf53Q8N3J3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C17orf53Q8N3J3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C17orf53Q8N3J3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C17orf53Q8N3J3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C17orf53Q8N3J3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C17orf53Q8N3J3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C17orf53Q8N3J3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C17orf53Q8N3J3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C17orf53Q8N3J3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C17orf53Q8N3J3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C17orf53Q8N3J3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C17orf53Q8N3J3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C17orf53Q8N3J3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C17orf53Q8N3J3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C17orf53Q8N3J3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C17orf53Q8N3J3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C17orf53Q8N3J3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.6 ms