Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Polr1eQ8K202 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Polr1eQ8K202 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Polr1eQ8K202 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Polr1eQ8K202 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Polr1eQ8K202 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Polr1eQ8K202 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Polr1eQ8K202 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Polr1eQ8K202 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Polr1eQ8K202 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Polr1eQ8K202 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Polr1eQ8K202 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Polr1eQ8K202 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Polr1eQ8K202 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Polr1eQ8K202 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Polr1eQ8K202 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Polr1eQ8K202 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Polr1eQ8K202 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Polr1eQ8K202 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Polr1eQ8K202 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Polr1eQ8K202 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Polr1eQ8K202 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Polr1eQ8K202 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Polr1eQ8K202 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Polr1eQ8K202 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Polr1eQ8K202 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Polr1eQ8K202 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Polr1eQ8K202 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Polr1eQ8K202 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Polr1eQ8K202 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Polr1eQ8K202 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Polr1eQ8K202 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Polr1eQ8K202 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Polr1eQ8K202 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Polr1eQ8K202 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Polr1eQ8K202 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Polr1eQ8K202 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Polr1eQ8K202 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Polr1eQ8K202 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Polr1eQ8K202 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Polr1eQ8K202 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Polr1eQ8K202 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Polr1eQ8K202 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Polr1eQ8K202 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Polr1eQ8K202 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Polr1eQ8K202 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Polr1eQ8K202 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Polr1eQ8K202 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Polr1eQ8K202 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Polr1eQ8K202 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Polr1eQ8K202 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Polr1eQ8K202 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Polr1eQ8K202 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Polr1eQ8K202 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Polr1eQ8K202 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Polr1eQ8K202 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Polr1eQ8K202 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Polr1eQ8K202 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Polr1eQ8K202 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Polr1eQ8K202 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Polr1eQ8K202 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Polr1eQ8K202 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Polr1eQ8K202 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Polr1eQ8K202 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Polr1eQ8K202 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Polr1eQ8K202 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms