Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms