Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC83Q8IWF9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC83Q8IWF9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC83Q8IWF9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC83Q8IWF9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC83Q8IWF9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC83Q8IWF9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC83Q8IWF9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC83Q8IWF9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC83Q8IWF9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC83Q8IWF9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC83Q8IWF9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC83Q8IWF9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC83Q8IWF9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC83Q8IWF9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC83Q8IWF9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC83Q8IWF9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC83Q8IWF9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC83Q8IWF9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC83Q8IWF9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC83Q8IWF9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC83Q8IWF9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC83Q8IWF9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC83Q8IWF9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC83Q8IWF9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC83Q8IWF9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC83Q8IWF9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC83Q8IWF9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC83Q8IWF9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC83Q8IWF9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC83Q8IWF9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC83Q8IWF9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC83Q8IWF9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC83Q8IWF9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC83Q8IWF9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC83Q8IWF9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC83Q8IWF9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC83Q8IWF9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC83Q8IWF9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC83Q8IWF9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC83Q8IWF9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC83Q8IWF9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC83Q8IWF9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC83Q8IWF9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC83Q8IWF9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC83Q8IWF9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC83Q8IWF9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC83Q8IWF9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC83Q8IWF9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC83Q8IWF9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC83Q8IWF9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC83Q8IWF9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC83Q8IWF9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC83Q8IWF9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC83Q8IWF9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC83Q8IWF9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC83Q8IWF9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC83Q8IWF9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC83Q8IWF9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC83Q8IWF9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC83Q8IWF9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC83Q8IWF9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC83Q8IWF9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC83Q8IWF9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC83Q8IWF9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC83Q8IWF9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC83Q8IWF9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC83Q8IWF9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC83Q8IWF9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC83Q8IWF9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC83Q8IWF9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC83Q8IWF9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC83Q8IWF9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC83Q8IWF9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC83Q8IWF9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC83Q8IWF9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC83Q8IWF9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC83Q8IWF9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC83Q8IWF9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC83Q8IWF9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC83Q8IWF9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC83Q8IWF9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC83Q8IWF9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC83Q8IWF9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC83Q8IWF9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC83Q8IWF9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC83Q8IWF9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC83Q8IWF9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC83Q8IWF9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC83Q8IWF9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC83Q8IWF9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC83Q8IWF9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC83Q8IWF9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC83Q8IWF9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC83Q8IWF9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC83Q8IWF9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC83Q8IWF9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC83Q8IWF9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC83Q8IWF9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CCDC83Q8IWF9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms