Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp27Q8CEG8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp27Q8CEG8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp27Q8CEG8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp27Q8CEG8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp27Q8CEG8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp27Q8CEG8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp27Q8CEG8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp27Q8CEG8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp27Q8CEG8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp27Q8CEG8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp27Q8CEG8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp27Q8CEG8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp27Q8CEG8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp27Q8CEG8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp27Q8CEG8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp27Q8CEG8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp27Q8CEG8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp27Q8CEG8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp27Q8CEG8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp27Q8CEG8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp27Q8CEG8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp27Q8CEG8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp27Q8CEG8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp27Q8CEG8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp27Q8CEG8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp27Q8CEG8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp27Q8CEG8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp27Q8CEG8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp27Q8CEG8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp27Q8CEG8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp27Q8CEG8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp27Q8CEG8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp27Q8CEG8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp27Q8CEG8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp27Q8CEG8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp27Q8CEG8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp27Q8CEG8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp27Q8CEG8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp27Q8CEG8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp27Q8CEG8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp27Q8CEG8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp27Q8CEG8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp27Q8CEG8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp27Q8CEG8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp27Q8CEG8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp27Q8CEG8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp27Q8CEG8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp27Q8CEG8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp27Q8CEG8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp27Q8CEG8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp27Q8CEG8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp27Q8CEG8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp27Q8CEG8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp27Q8CEG8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp27Q8CEG8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp27Q8CEG8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp27Q8CEG8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp27Q8CEG8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp27Q8CEG8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp27Q8CEG8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
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Usp27Q8CEG8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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Usp27Q8CEG8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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Usp27Q8CEG8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp27Q8CEG8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp27Q8CEG8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp27Q8CEG8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp27Q8CEG8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp27Q8CEG8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp27Q8CEG8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp27Q8CEG8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp27Q8CEG8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp27Q8CEG8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp27Q8CEG8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp27Q8CEG8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp27Q8CEG8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp27Q8CEG8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp27Q8CEG8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp27Q8CEG8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp27Q8CEG8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp27Q8CEG8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp27Q8CEG8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp27Q8CEG8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp27Q8CEG8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp27Q8CEG8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp27Q8CEG8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp27Q8CEG8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp27Q8CEG8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp27Q8CEG8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp27Q8CEG8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp27Q8CEG8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp27Q8CEG8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp27Q8CEG8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 164.8 ms