Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
E4f1Q8CCE9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
E4f1Q8CCE9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
E4f1Q8CCE9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
E4f1Q8CCE9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
E4f1Q8CCE9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
E4f1Q8CCE9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
E4f1Q8CCE9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
E4f1Q8CCE9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
E4f1Q8CCE9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
E4f1Q8CCE9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
E4f1Q8CCE9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
E4f1Q8CCE9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
E4f1Q8CCE9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
E4f1Q8CCE9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
E4f1Q8CCE9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
E4f1Q8CCE9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
E4f1Q8CCE9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
E4f1Q8CCE9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
E4f1Q8CCE9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
E4f1Q8CCE9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
E4f1Q8CCE9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
E4f1Q8CCE9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
E4f1Q8CCE9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
E4f1Q8CCE9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
E4f1Q8CCE9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
E4f1Q8CCE9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
E4f1Q8CCE9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
E4f1Q8CCE9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
E4f1Q8CCE9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
E4f1Q8CCE9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
E4f1Q8CCE9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
E4f1Q8CCE9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
E4f1Q8CCE9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
E4f1Q8CCE9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
E4f1Q8CCE9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
E4f1Q8CCE9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
E4f1Q8CCE9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
E4f1Q8CCE9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
E4f1Q8CCE9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
E4f1Q8CCE9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
E4f1Q8CCE9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
E4f1Q8CCE9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
E4f1Q8CCE9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
E4f1Q8CCE9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
E4f1Q8CCE9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
E4f1Q8CCE9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
E4f1Q8CCE9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
E4f1Q8CCE9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
E4f1Q8CCE9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
E4f1Q8CCE9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
E4f1Q8CCE9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
E4f1Q8CCE9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
E4f1Q8CCE9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
E4f1Q8CCE9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
E4f1Q8CCE9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
E4f1Q8CCE9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
E4f1Q8CCE9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
E4f1Q8CCE9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
E4f1Q8CCE9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
E4f1Q8CCE9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
E4f1Q8CCE9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
E4f1Q8CCE9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
E4f1Q8CCE9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
E4f1Q8CCE9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
E4f1Q8CCE9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
E4f1Q8CCE9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
E4f1Q8CCE9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
E4f1Q8CCE9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
E4f1Q8CCE9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
E4f1Q8CCE9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
E4f1Q8CCE9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
E4f1Q8CCE9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
E4f1Q8CCE9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
E4f1Q8CCE9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
E4f1Q8CCE9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
E4f1Q8CCE9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
E4f1Q8CCE9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
E4f1Q8CCE9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
E4f1Q8CCE9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
E4f1Q8CCE9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
E4f1Q8CCE9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
E4f1Q8CCE9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
E4f1Q8CCE9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
E4f1Q8CCE9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
E4f1Q8CCE9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
E4f1Q8CCE9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
E4f1Q8CCE9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
E4f1Q8CCE9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
E4f1Q8CCE9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
E4f1Q8CCE9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
E4f1Q8CCE9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
E4f1Q8CCE9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
E4f1Q8CCE9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E4f1Q8CCE9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
E4f1Q8CCE9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E4f1Q8CCE9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
E4f1Q8CCE9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E4f1Q8CCE9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
E4f1Q8CCE9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms