Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3F7

Klhl30, Kelch-like protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl30Q8C3F7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhl30Q8C3F7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhl30Q8C3F7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhl30Q8C3F7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhl30Q8C3F7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhl30Q8C3F7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhl30Q8C3F7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhl30Q8C3F7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhl30Q8C3F7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhl30Q8C3F7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhl30Q8C3F7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhl30Q8C3F7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhl30Q8C3F7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhl30Q8C3F7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhl30Q8C3F7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klhl30Q8C3F7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klhl30Q8C3F7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klhl30Q8C3F7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klhl30Q8C3F7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klhl30Q8C3F7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klhl30Q8C3F7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klhl30Q8C3F7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klhl30Q8C3F7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klhl30Q8C3F7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klhl30Q8C3F7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klhl30Q8C3F7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klhl30Q8C3F7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klhl30Q8C3F7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klhl30Q8C3F7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klhl30Q8C3F7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klhl30Q8C3F7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klhl30Q8C3F7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klhl30Q8C3F7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klhl30Q8C3F7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klhl30Q8C3F7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Klhl30Q8C3F7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klhl30Q8C3F7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klhl30Q8C3F7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klhl30Q8C3F7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klhl30Q8C3F7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klhl30Q8C3F7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klhl30Q8C3F7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klhl30Q8C3F7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klhl30Q8C3F7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klhl30Q8C3F7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klhl30Q8C3F7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klhl30Q8C3F7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klhl30Q8C3F7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klhl30Q8C3F7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klhl30Q8C3F7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klhl30Q8C3F7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klhl30Q8C3F7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klhl30Q8C3F7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klhl30Q8C3F7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klhl30Q8C3F7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klhl30Q8C3F7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klhl30Q8C3F7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klhl30Q8C3F7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klhl30Q8C3F7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Klhl30Q8C3F7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klhl30Q8C3F7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klhl30Q8C3F7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klhl30Q8C3F7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klhl30Q8C3F7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klhl30Q8C3F7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klhl30Q8C3F7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klhl30Q8C3F7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klhl30Q8C3F7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhl30Q8C3F7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhl30Q8C3F7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhl30Q8C3F7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhl30Q8C3F7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhl30Q8C3F7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhl30Q8C3F7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhl30Q8C3F7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhl30Q8C3F7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhl30Q8C3F7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhl30Q8C3F7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhl30Q8C3F7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhl30Q8C3F7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhl30Q8C3F7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhl30Q8C3F7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klhl30Q8C3F7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klhl30Q8C3F7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klhl30Q8C3F7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klhl30Q8C3F7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhl30Q8C3F7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhl30Q8C3F7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhl30Q8C3F7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhl30Q8C3F7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhl30Q8C3F7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhl30Q8C3F7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhl30Q8C3F7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhl30Q8C3F7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhl30Q8C3F7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhl30Q8C3F7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhl30Q8C3F7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhl30Q8C3F7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhl30Q8C3F7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhl30Q8C3F7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms