Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z392

TRAPPC11, Trafficking protein particle complex subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC11Q7Z392 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRAPPC11Q7Z392 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
TRAPPC11Q7Z392 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRAPPC11Q7Z392 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRAPPC11Q7Z392 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRAPPC11Q7Z392 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC11Q7Z392 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC11Q7Z392 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC11Q7Z392 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC11Q7Z392 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC11Q7Z392 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC11Q7Z392 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC11Q7Z392 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC11Q7Z392 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC11Q7Z392 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC11Q7Z392 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC11Q7Z392 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC11Q7Z392 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC11Q7Z392 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC11Q7Z392 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC11Q7Z392 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC11Q7Z392 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC11Q7Z392 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC11Q7Z392 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC11Q7Z392 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC11Q7Z392 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC11Q7Z392 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC11Q7Z392 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC11Q7Z392 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC11Q7Z392 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC11Q7Z392 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC11Q7Z392 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC11Q7Z392 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC11Q7Z392 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC11Q7Z392 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC11Q7Z392 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC11Q7Z392 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC11Q7Z392 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC11Q7Z392 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC11Q7Z392 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC11Q7Z392 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC11Q7Z392 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC11Q7Z392 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC11Q7Z392 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC11Q7Z392 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC11Q7Z392 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC11Q7Z392 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC11Q7Z392 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC11Q7Z392 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRAPPC11Q7Z392 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRAPPC11Q7Z392 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRAPPC11Q7Z392 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC11Q7Z392 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC11Q7Z392 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC11Q7Z392 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC11Q7Z392 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC11Q7Z392 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC11Q7Z392 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC11Q7Z392 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC11Q7Z392 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC11Q7Z392 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC11Q7Z392 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC11Q7Z392 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC11Q7Z392 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC11Q7Z392 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC11Q7Z392 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC11Q7Z392 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC11Q7Z392 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC11Q7Z392 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms