Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SynmQ70IV5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SynmQ70IV5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
SynmQ70IV5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SynmQ70IV5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SynmQ70IV5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
SynmQ70IV5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
SynmQ70IV5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SynmQ70IV5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SynmQ70IV5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SynmQ70IV5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SynmQ70IV5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SynmQ70IV5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SynmQ70IV5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SynmQ70IV5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SynmQ70IV5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
SynmQ70IV5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SynmQ70IV5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SynmQ70IV5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SynmQ70IV5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SynmQ70IV5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SynmQ70IV5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SynmQ70IV5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SynmQ70IV5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
SynmQ70IV5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
SynmQ70IV5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SynmQ70IV5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SynmQ70IV5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SynmQ70IV5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SynmQ70IV5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SynmQ70IV5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SynmQ70IV5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SynmQ70IV5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
SynmQ70IV5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SynmQ70IV5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SynmQ70IV5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SynmQ70IV5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SynmQ70IV5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SynmQ70IV5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SynmQ70IV5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SynmQ70IV5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SynmQ70IV5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SynmQ70IV5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SynmQ70IV5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SynmQ70IV5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SynmQ70IV5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
SynmQ70IV5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
SynmQ70IV5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SynmQ70IV5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SynmQ70IV5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SynmQ70IV5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SynmQ70IV5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SynmQ70IV5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SynmQ70IV5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SynmQ70IV5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
SynmQ70IV5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SynmQ70IV5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SynmQ70IV5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SynmQ70IV5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SynmQ70IV5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SynmQ70IV5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SynmQ70IV5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SynmQ70IV5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SynmQ70IV5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SynmQ70IV5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SynmQ70IV5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SynmQ70IV5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SynmQ70IV5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SynmQ70IV5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SynmQ70IV5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SynmQ70IV5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SynmQ70IV5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SynmQ70IV5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SynmQ70IV5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SynmQ70IV5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SynmQ70IV5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SynmQ70IV5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SynmQ70IV5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SynmQ70IV5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SynmQ70IV5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SynmQ70IV5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
SynmQ70IV5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SynmQ70IV5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SynmQ70IV5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SynmQ70IV5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SynmQ70IV5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SynmQ70IV5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
SynmQ70IV5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SynmQ70IV5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SynmQ70IV5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SynmQ70IV5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SynmQ70IV5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SynmQ70IV5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SynmQ70IV5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SynmQ70IV5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SynmQ70IV5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SynmQ70IV5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SynmQ70IV5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SynmQ70IV5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SynmQ70IV5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms