Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWU9

Rps27, 40S ribosomal protein S27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27Q6ZWU9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps27Q6ZWU9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps27Q6ZWU9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps27Q6ZWU9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps27Q6ZWU9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps27Q6ZWU9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps27Q6ZWU9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps27Q6ZWU9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps27Q6ZWU9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps27Q6ZWU9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps27Q6ZWU9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps27Q6ZWU9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps27Q6ZWU9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps27Q6ZWU9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps27Q6ZWU9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps27Q6ZWU9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps27Q6ZWU9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps27Q6ZWU9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps27Q6ZWU9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps27Q6ZWU9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps27Q6ZWU9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps27Q6ZWU9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps27Q6ZWU9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps27Q6ZWU9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps27Q6ZWU9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps27Q6ZWU9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps27Q6ZWU9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps27Q6ZWU9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps27Q6ZWU9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps27Q6ZWU9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps27Q6ZWU9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps27Q6ZWU9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps27Q6ZWU9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps27Q6ZWU9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps27Q6ZWU9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps27Q6ZWU9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps27Q6ZWU9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps27Q6ZWU9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps27Q6ZWU9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps27Q6ZWU9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps27Q6ZWU9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps27Q6ZWU9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps27Q6ZWU9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps27Q6ZWU9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps27Q6ZWU9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps27Q6ZWU9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps27Q6ZWU9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps27Q6ZWU9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps27Q6ZWU9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps27Q6ZWU9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps27Q6ZWU9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps27Q6ZWU9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps27Q6ZWU9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps27Q6ZWU9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps27Q6ZWU9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rps27Q6ZWU9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rps27Q6ZWU9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rps27Q6ZWU9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rps27Q6ZWU9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rps27Q6ZWU9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rps27Q6ZWU9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps27Q6ZWU9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps27Q6ZWU9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps27Q6ZWU9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps27Q6ZWU9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps27Q6ZWU9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps27Q6ZWU9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps27Q6ZWU9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps27Q6ZWU9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps27Q6ZWU9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps27Q6ZWU9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps27Q6ZWU9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps27Q6ZWU9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps27Q6ZWU9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps27Q6ZWU9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps27Q6ZWU9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps27Q6ZWU9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps27Q6ZWU9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps27Q6ZWU9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps27Q6ZWU9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps27Q6ZWU9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps27Q6ZWU9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps27Q6ZWU9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps27Q6ZWU9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps27Q6ZWU9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps27Q6ZWU9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps27Q6ZWU9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps27Q6ZWU9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps27Q6ZWU9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps27Q6ZWU9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps27Q6ZWU9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps27Q6ZWU9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps27Q6ZWU9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps27Q6ZWU9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps27Q6ZWU9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps27Q6ZWU9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps27Q6ZWU9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps27Q6ZWU9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps27Q6ZWU9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps27Q6ZWU9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms