Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
LRRC9Q6ZRR7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
LRRC9Q6ZRR7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
LRRC9Q6ZRR7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
LRRC9Q6ZRR7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
LRRC9Q6ZRR7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
LRRC9Q6ZRR7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
LRRC9Q6ZRR7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
LRRC9Q6ZRR7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
LRRC9Q6ZRR7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
LRRC9Q6ZRR7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
LRRC9Q6ZRR7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
LRRC9Q6ZRR7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
LRRC9Q6ZRR7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
LRRC9Q6ZRR7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
LRRC9Q6ZRR7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
LRRC9Q6ZRR7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
LRRC9Q6ZRR7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
LRRC9Q6ZRR7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
LRRC9Q6ZRR7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
LRRC9Q6ZRR7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
LRRC9Q6ZRR7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
LRRC9Q6ZRR7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
LRRC9Q6ZRR7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
LRRC9Q6ZRR7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
LRRC9Q6ZRR7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
LRRC9Q6ZRR7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
LRRC9Q6ZRR7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
LRRC9Q6ZRR7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
LRRC9Q6ZRR7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
LRRC9Q6ZRR7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
LRRC9Q6ZRR7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
LRRC9Q6ZRR7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
LRRC9Q6ZRR7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC34.91■■■■□ 3.18
LRRC9Q6ZRR7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
LRRC9Q6ZRR7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC34.9■■■■□ 3.18
LRRC9Q6ZRR7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
LRRC9Q6ZRR7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
LRRC9Q6ZRR7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
LRRC9Q6ZRR7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
LRRC9Q6ZRR7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
LRRC9Q6ZRR7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
LRRC9Q6ZRR7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
LRRC9Q6ZRR7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
LRRC9Q6ZRR7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
LRRC9Q6ZRR7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
LRRC9Q6ZRR7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
LRRC9Q6ZRR7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
LRRC9Q6ZRR7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
LRRC9Q6ZRR7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
LRRC9Q6ZRR7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
LRRC9Q6ZRR7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
LRRC9Q6ZRR7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
LRRC9Q6ZRR7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
LRRC9Q6ZRR7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
LRRC9Q6ZRR7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
LRRC9Q6ZRR7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
LRRC9Q6ZRR7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
LRRC9Q6ZRR7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
LRRC9Q6ZRR7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
LRRC9Q6ZRR7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
LRRC9Q6ZRR7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC34.86■■■■□ 3.17
LRRC9Q6ZRR7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
LRRC9Q6ZRR7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
LRRC9Q6ZRR7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
LRRC9Q6ZRR7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
LRRC9Q6ZRR7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
LRRC9Q6ZRR7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
LRRC9Q6ZRR7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
LRRC9Q6ZRR7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
LRRC9Q6ZRR7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
LRRC9Q6ZRR7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
LRRC9Q6ZRR7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
LRRC9Q6ZRR7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
LRRC9Q6ZRR7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
LRRC9Q6ZRR7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
LRRC9Q6ZRR7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
LRRC9Q6ZRR7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
LRRC9Q6ZRR7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
LRRC9Q6ZRR7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
LRRC9Q6ZRR7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
LRRC9Q6ZRR7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
LRRC9Q6ZRR7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
LRRC9Q6ZRR7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
LRRC9Q6ZRR7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
LRRC9Q6ZRR7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
LRRC9Q6ZRR7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
LRRC9Q6ZRR7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
LRRC9Q6ZRR7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
LRRC9Q6ZRR7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
LRRC9Q6ZRR7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
LRRC9Q6ZRR7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
LRRC9Q6ZRR7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
LRRC9Q6ZRR7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
LRRC9Q6ZRR7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
LRRC9Q6ZRR7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
LRRC9Q6ZRR7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
LRRC9Q6ZRR7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
LRRC9Q6ZRR7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
LRRC9Q6ZRR7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms