Protein–RNA interactions for Protein: Q6RKD8

Flrt1, Leucine-rich repeat transmembrane protein FLRT1, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flrt1Q6RKD8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Flrt1Q6RKD8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Flrt1Q6RKD8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Flrt1Q6RKD8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Flrt1Q6RKD8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Flrt1Q6RKD8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Flrt1Q6RKD8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Flrt1Q6RKD8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Flrt1Q6RKD8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Flrt1Q6RKD8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Flrt1Q6RKD8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Flrt1Q6RKD8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Flrt1Q6RKD8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Flrt1Q6RKD8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Flrt1Q6RKD8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Flrt1Q6RKD8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Flrt1Q6RKD8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Flrt1Q6RKD8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Flrt1Q6RKD8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Flrt1Q6RKD8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Flrt1Q6RKD8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Flrt1Q6RKD8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms