Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2P8

Neil2, Endonuclease 8-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil2Q6R2P8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms