Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2P8

Neil2, Endonuclease 8-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil2Q6R2P8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Neil2Q6R2P8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Neil2Q6R2P8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms