Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8X1

Snx6, Sorting nexin-6, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx6Q6P8X1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snx6Q6P8X1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snx6Q6P8X1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snx6Q6P8X1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snx6Q6P8X1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snx6Q6P8X1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snx6Q6P8X1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snx6Q6P8X1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snx6Q6P8X1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snx6Q6P8X1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx6Q6P8X1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx6Q6P8X1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx6Q6P8X1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx6Q6P8X1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx6Q6P8X1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx6Q6P8X1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx6Q6P8X1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx6Q6P8X1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx6Q6P8X1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx6Q6P8X1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx6Q6P8X1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx6Q6P8X1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx6Q6P8X1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx6Q6P8X1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx6Q6P8X1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx6Q6P8X1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx6Q6P8X1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx6Q6P8X1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx6Q6P8X1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx6Q6P8X1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx6Q6P8X1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx6Q6P8X1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx6Q6P8X1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx6Q6P8X1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx6Q6P8X1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx6Q6P8X1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Snx6Q6P8X1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx6Q6P8X1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx6Q6P8X1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx6Q6P8X1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx6Q6P8X1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx6Q6P8X1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx6Q6P8X1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx6Q6P8X1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx6Q6P8X1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx6Q6P8X1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx6Q6P8X1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx6Q6P8X1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx6Q6P8X1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx6Q6P8X1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx6Q6P8X1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx6Q6P8X1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx6Q6P8X1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx6Q6P8X1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx6Q6P8X1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx6Q6P8X1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx6Q6P8X1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx6Q6P8X1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx6Q6P8X1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx6Q6P8X1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx6Q6P8X1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx6Q6P8X1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx6Q6P8X1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx6Q6P8X1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx6Q6P8X1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx6Q6P8X1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx6Q6P8X1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx6Q6P8X1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx6Q6P8X1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx6Q6P8X1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx6Q6P8X1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx6Q6P8X1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx6Q6P8X1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx6Q6P8X1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx6Q6P8X1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx6Q6P8X1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx6Q6P8X1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx6Q6P8X1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx6Q6P8X1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx6Q6P8X1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx6Q6P8X1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx6Q6P8X1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx6Q6P8X1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx6Q6P8X1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx6Q6P8X1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx6Q6P8X1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx6Q6P8X1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx6Q6P8X1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx6Q6P8X1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx6Q6P8X1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx6Q6P8X1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx6Q6P8X1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx6Q6P8X1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx6Q6P8X1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx6Q6P8X1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx6Q6P8X1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx6Q6P8X1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx6Q6P8X1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx6Q6P8X1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx6Q6P8X1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms