Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE8

Wdr44, WD repeat-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr44Q6NVE8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Wdr44Q6NVE8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Wdr44Q6NVE8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Wdr44Q6NVE8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Wdr44Q6NVE8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Wdr44Q6NVE8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Wdr44Q6NVE8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Wdr44Q6NVE8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Wdr44Q6NVE8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Wdr44Q6NVE8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Wdr44Q6NVE8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Wdr44Q6NVE8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Wdr44Q6NVE8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Wdr44Q6NVE8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Wdr44Q6NVE8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Wdr44Q6NVE8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Wdr44Q6NVE8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Wdr44Q6NVE8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Wdr44Q6NVE8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Wdr44Q6NVE8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Wdr44Q6NVE8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Wdr44Q6NVE8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Wdr44Q6NVE8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Wdr44Q6NVE8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Wdr44Q6NVE8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Wdr44Q6NVE8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Wdr44Q6NVE8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Wdr44Q6NVE8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Wdr44Q6NVE8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Wdr44Q6NVE8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Wdr44Q6NVE8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Wdr44Q6NVE8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Wdr44Q6NVE8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Wdr44Q6NVE8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Wdr44Q6NVE8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Wdr44Q6NVE8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Wdr44Q6NVE8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Wdr44Q6NVE8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Wdr44Q6NVE8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Wdr44Q6NVE8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Wdr44Q6NVE8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Wdr44Q6NVE8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Wdr44Q6NVE8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Wdr44Q6NVE8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Wdr44Q6NVE8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Wdr44Q6NVE8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Wdr44Q6NVE8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Wdr44Q6NVE8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Wdr44Q6NVE8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Wdr44Q6NVE8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Wdr44Q6NVE8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Wdr44Q6NVE8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Wdr44Q6NVE8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Wdr44Q6NVE8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Wdr44Q6NVE8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Wdr44Q6NVE8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Wdr44Q6NVE8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Wdr44Q6NVE8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Wdr44Q6NVE8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Wdr44Q6NVE8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Wdr44Q6NVE8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Wdr44Q6NVE8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Wdr44Q6NVE8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Wdr44Q6NVE8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Wdr44Q6NVE8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Wdr44Q6NVE8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Wdr44Q6NVE8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Wdr44Q6NVE8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Wdr44Q6NVE8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Wdr44Q6NVE8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Wdr44Q6NVE8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Wdr44Q6NVE8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Wdr44Q6NVE8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Wdr44Q6NVE8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Wdr44Q6NVE8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Wdr44Q6NVE8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Wdr44Q6NVE8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Wdr44Q6NVE8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Wdr44Q6NVE8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Wdr44Q6NVE8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Wdr44Q6NVE8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Wdr44Q6NVE8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Wdr44Q6NVE8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Wdr44Q6NVE8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Wdr44Q6NVE8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Wdr44Q6NVE8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Wdr44Q6NVE8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Wdr44Q6NVE8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Wdr44Q6NVE8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Wdr44Q6NVE8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Wdr44Q6NVE8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Wdr44Q6NVE8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Wdr44Q6NVE8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Wdr44Q6NVE8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Wdr44Q6NVE8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Wdr44Q6NVE8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Wdr44Q6NVE8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Wdr44Q6NVE8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Wdr44Q6NVE8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Wdr44Q6NVE8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms