Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rftn1Q6A0D4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rftn1Q6A0D4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rftn1Q6A0D4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Rftn1Q6A0D4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rftn1Q6A0D4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rftn1Q6A0D4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Rftn1Q6A0D4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rftn1Q6A0D4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rftn1Q6A0D4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rftn1Q6A0D4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rftn1Q6A0D4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rftn1Q6A0D4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rftn1Q6A0D4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rftn1Q6A0D4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rftn1Q6A0D4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rftn1Q6A0D4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rftn1Q6A0D4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rftn1Q6A0D4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rftn1Q6A0D4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rftn1Q6A0D4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Rftn1Q6A0D4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Rftn1Q6A0D4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rftn1Q6A0D4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rftn1Q6A0D4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rftn1Q6A0D4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rftn1Q6A0D4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rftn1Q6A0D4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rftn1Q6A0D4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rftn1Q6A0D4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rftn1Q6A0D4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rftn1Q6A0D4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rftn1Q6A0D4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rftn1Q6A0D4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rftn1Q6A0D4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rftn1Q6A0D4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rftn1Q6A0D4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rftn1Q6A0D4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rftn1Q6A0D4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Rftn1Q6A0D4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rftn1Q6A0D4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rftn1Q6A0D4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rftn1Q6A0D4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rftn1Q6A0D4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rftn1Q6A0D4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rftn1Q6A0D4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rftn1Q6A0D4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rftn1Q6A0D4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rftn1Q6A0D4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rftn1Q6A0D4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rftn1Q6A0D4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rftn1Q6A0D4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rftn1Q6A0D4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rftn1Q6A0D4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rftn1Q6A0D4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rftn1Q6A0D4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rftn1Q6A0D4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rftn1Q6A0D4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rftn1Q6A0D4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rftn1Q6A0D4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rftn1Q6A0D4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rftn1Q6A0D4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rftn1Q6A0D4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rftn1Q6A0D4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rftn1Q6A0D4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rftn1Q6A0D4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rftn1Q6A0D4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rftn1Q6A0D4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rftn1Q6A0D4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rftn1Q6A0D4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rftn1Q6A0D4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rftn1Q6A0D4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rftn1Q6A0D4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rftn1Q6A0D4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rftn1Q6A0D4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rftn1Q6A0D4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Rftn1Q6A0D4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rftn1Q6A0D4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rftn1Q6A0D4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rftn1Q6A0D4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rftn1Q6A0D4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rftn1Q6A0D4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rftn1Q6A0D4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rftn1Q6A0D4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rftn1Q6A0D4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rftn1Q6A0D4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rftn1Q6A0D4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rftn1Q6A0D4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rftn1Q6A0D4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rftn1Q6A0D4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rftn1Q6A0D4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rftn1Q6A0D4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rftn1Q6A0D4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rftn1Q6A0D4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rftn1Q6A0D4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rftn1Q6A0D4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rftn1Q6A0D4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rftn1Q6A0D4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rftn1Q6A0D4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rftn1Q6A0D4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms