Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z37

Samd9l, Sterile alpha motif domain-containing protein 9-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd9lQ69Z37 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Samd9lQ69Z37 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
Samd9lQ69Z37 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Samd9lQ69Z37 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Samd9lQ69Z37 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Samd9lQ69Z37 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Samd9lQ69Z37 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Samd9lQ69Z37 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Samd9lQ69Z37 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Samd9lQ69Z37 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Samd9lQ69Z37 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Samd9lQ69Z37 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Samd9lQ69Z37 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
Samd9lQ69Z37 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Samd9lQ69Z37 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Samd9lQ69Z37 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Samd9lQ69Z37 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Samd9lQ69Z37 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Samd9lQ69Z37 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Samd9lQ69Z37 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Samd9lQ69Z37 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Samd9lQ69Z37 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
Samd9lQ69Z37 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Samd9lQ69Z37 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Samd9lQ69Z37 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Samd9lQ69Z37 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Samd9lQ69Z37 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Samd9lQ69Z37 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Samd9lQ69Z37 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Samd9lQ69Z37 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Samd9lQ69Z37 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
Samd9lQ69Z37 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Samd9lQ69Z37 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Samd9lQ69Z37 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Samd9lQ69Z37 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Samd9lQ69Z37 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Samd9lQ69Z37 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Samd9lQ69Z37 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Samd9lQ69Z37 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Samd9lQ69Z37 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Samd9lQ69Z37 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Samd9lQ69Z37 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Samd9lQ69Z37 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Samd9lQ69Z37 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Samd9lQ69Z37 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Samd9lQ69Z37 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Samd9lQ69Z37 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Samd9lQ69Z37 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Samd9lQ69Z37 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Samd9lQ69Z37 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Samd9lQ69Z37 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Samd9lQ69Z37 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Samd9lQ69Z37 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
Samd9lQ69Z37 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Samd9lQ69Z37 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Samd9lQ69Z37 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Samd9lQ69Z37 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Samd9lQ69Z37 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Samd9lQ69Z37 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Samd9lQ69Z37 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Samd9lQ69Z37 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Samd9lQ69Z37 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Samd9lQ69Z37 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Samd9lQ69Z37 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Samd9lQ69Z37 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Samd9lQ69Z37 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Samd9lQ69Z37 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Samd9lQ69Z37 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Samd9lQ69Z37 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Samd9lQ69Z37 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Samd9lQ69Z37 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Samd9lQ69Z37 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
Samd9lQ69Z37 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Samd9lQ69Z37 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Samd9lQ69Z37 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Samd9lQ69Z37 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
Samd9lQ69Z37 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Samd9lQ69Z37 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Samd9lQ69Z37 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
Samd9lQ69Z37 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Samd9lQ69Z37 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Samd9lQ69Z37 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Samd9lQ69Z37 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Samd9lQ69Z37 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Samd9lQ69Z37 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Samd9lQ69Z37 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Samd9lQ69Z37 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Samd9lQ69Z37 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Samd9lQ69Z37 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Samd9lQ69Z37 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Samd9lQ69Z37 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
Samd9lQ69Z37 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Samd9lQ69Z37 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Samd9lQ69Z37 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Samd9lQ69Z37 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Samd9lQ69Z37 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
Samd9lQ69Z37 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Samd9lQ69Z37 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Samd9lQ69Z37 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Samd9lQ69Z37 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms