Protein–RNA interactions for Protein: Q66X19

Nlrp4e, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4E, mousemouse

Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4eQ66X19 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nlrp4eQ66X19 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nlrp4eQ66X19 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nlrp4eQ66X19 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nlrp4eQ66X19 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nlrp4eQ66X19 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nlrp4eQ66X19 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nlrp4eQ66X19 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nlrp4eQ66X19 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nlrp4eQ66X19 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nlrp4eQ66X19 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nlrp4eQ66X19 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nlrp4eQ66X19 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nlrp4eQ66X19 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Nlrp4eQ66X19 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nlrp4eQ66X19 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nlrp4eQ66X19 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nlrp4eQ66X19 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nlrp4eQ66X19 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nlrp4eQ66X19 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nlrp4eQ66X19 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nlrp4eQ66X19 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nlrp4eQ66X19 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nlrp4eQ66X19 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nlrp4eQ66X19 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nlrp4eQ66X19 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nlrp4eQ66X19 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nlrp4eQ66X19 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nlrp4eQ66X19 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nlrp4eQ66X19 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nlrp4eQ66X19 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nlrp4eQ66X19 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nlrp4eQ66X19 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nlrp4eQ66X19 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nlrp4eQ66X19 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nlrp4eQ66X19 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nlrp4eQ66X19 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nlrp4eQ66X19 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nlrp4eQ66X19 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nlrp4eQ66X19 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nlrp4eQ66X19 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nlrp4eQ66X19 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nlrp4eQ66X19 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nlrp4eQ66X19 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nlrp4eQ66X19 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nlrp4eQ66X19 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nlrp4eQ66X19 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nlrp4eQ66X19 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nlrp4eQ66X19 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nlrp4eQ66X19 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Nlrp4eQ66X19 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nlrp4eQ66X19 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nlrp4eQ66X19 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nlrp4eQ66X19 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nlrp4eQ66X19 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Nlrp4eQ66X19 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nlrp4eQ66X19 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nlrp4eQ66X19 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nlrp4eQ66X19 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nlrp4eQ66X19 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Nlrp4eQ66X19 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nlrp4eQ66X19 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nlrp4eQ66X19 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Nlrp4eQ66X19 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nlrp4eQ66X19 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nlrp4eQ66X19 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nlrp4eQ66X19 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nlrp4eQ66X19 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nlrp4eQ66X19 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nlrp4eQ66X19 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nlrp4eQ66X19 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nlrp4eQ66X19 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nlrp4eQ66X19 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nlrp4eQ66X19 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nlrp4eQ66X19 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nlrp4eQ66X19 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nlrp4eQ66X19 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nlrp4eQ66X19 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlrp4eQ66X19 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlrp4eQ66X19 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlrp4eQ66X19 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlrp4eQ66X19 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlrp4eQ66X19 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlrp4eQ66X19 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlrp4eQ66X19 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlrp4eQ66X19 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlrp4eQ66X19 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlrp4eQ66X19 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlrp4eQ66X19 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlrp4eQ66X19 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlrp4eQ66X19 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlrp4eQ66X19 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlrp4eQ66X19 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlrp4eQ66X19 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlrp4eQ66X19 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlrp4eQ66X19 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlrp4eQ66X19 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlrp4eQ66X19 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlrp4eQ66X19 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlrp4eQ66X19 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms