Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SnrpaQ62189 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SnrpaQ62189 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SnrpaQ62189 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SnrpaQ62189 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SnrpaQ62189 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SnrpaQ62189 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SnrpaQ62189 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SnrpaQ62189 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SnrpaQ62189 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SnrpaQ62189 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SnrpaQ62189 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SnrpaQ62189 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SnrpaQ62189 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SnrpaQ62189 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SnrpaQ62189 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SnrpaQ62189 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SnrpaQ62189 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SnrpaQ62189 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SnrpaQ62189 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SnrpaQ62189 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SnrpaQ62189 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SnrpaQ62189 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SnrpaQ62189 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SnrpaQ62189 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SnrpaQ62189 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SnrpaQ62189 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SnrpaQ62189 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SnrpaQ62189 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SnrpaQ62189 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SnrpaQ62189 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SnrpaQ62189 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SnrpaQ62189 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SnrpaQ62189 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SnrpaQ62189 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SnrpaQ62189 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SnrpaQ62189 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SnrpaQ62189 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SnrpaQ62189 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SnrpaQ62189 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SnrpaQ62189 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SnrpaQ62189 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SnrpaQ62189 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SnrpaQ62189 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SnrpaQ62189 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SnrpaQ62189 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SnrpaQ62189 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SnrpaQ62189 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SnrpaQ62189 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SnrpaQ62189 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SnrpaQ62189 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SnrpaQ62189 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SnrpaQ62189 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SnrpaQ62189 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SnrpaQ62189 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SnrpaQ62189 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SnrpaQ62189 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SnrpaQ62189 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SnrpaQ62189 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SnrpaQ62189 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SnrpaQ62189 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SnrpaQ62189 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SnrpaQ62189 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SnrpaQ62189 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SnrpaQ62189 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SnrpaQ62189 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SnrpaQ62189 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SnrpaQ62189 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SnrpaQ62189 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SnrpaQ62189 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SnrpaQ62189 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SnrpaQ62189 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SnrpaQ62189 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SnrpaQ62189 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SnrpaQ62189 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SnrpaQ62189 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SnrpaQ62189 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SnrpaQ62189 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SnrpaQ62189 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SnrpaQ62189 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SnrpaQ62189 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SnrpaQ62189 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SnrpaQ62189 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SnrpaQ62189 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SnrpaQ62189 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SnrpaQ62189 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SnrpaQ62189 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SnrpaQ62189 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SnrpaQ62189 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SnrpaQ62189 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SnrpaQ62189 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SnrpaQ62189 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SnrpaQ62189 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SnrpaQ62189 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SnrpaQ62189 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SnrpaQ62189 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SnrpaQ62189 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SnrpaQ62189 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SnrpaQ62189 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SnrpaQ62189 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms