Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcd2Q61285 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcd2Q61285 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcd2Q61285 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcd2Q61285 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcd2Q61285 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcd2Q61285 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcd2Q61285 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcd2Q61285 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcd2Q61285 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcd2Q61285 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcd2Q61285 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcd2Q61285 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcd2Q61285 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcd2Q61285 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcd2Q61285 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcd2Q61285 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcd2Q61285 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcd2Q61285 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcd2Q61285 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcd2Q61285 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcd2Q61285 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcd2Q61285 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcd2Q61285 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcd2Q61285 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcd2Q61285 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcd2Q61285 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcd2Q61285 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcd2Q61285 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcd2Q61285 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcd2Q61285 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcd2Q61285 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcd2Q61285 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcd2Q61285 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcd2Q61285 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcd2Q61285 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcd2Q61285 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Abcd2Q61285 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Abcd2Q61285 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Abcd2Q61285 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Abcd2Q61285 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Abcd2Q61285 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Abcd2Q61285 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Abcd2Q61285 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Abcd2Q61285 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Abcd2Q61285 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Abcd2Q61285 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Abcd2Q61285 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abcd2Q61285 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abcd2Q61285 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abcd2Q61285 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abcd2Q61285 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abcd2Q61285 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abcd2Q61285 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abcd2Q61285 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abcd2Q61285 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abcd2Q61285 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abcd2Q61285 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abcd2Q61285 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abcd2Q61285 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abcd2Q61285 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abcd2Q61285 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abcd2Q61285 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abcd2Q61285 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abcd2Q61285 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abcd2Q61285 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abcd2Q61285 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abcd2Q61285 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abcd2Q61285 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abcd2Q61285 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abcd2Q61285 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abcd2Q61285 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abcd2Q61285 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Abcd2Q61285 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abcd2Q61285 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abcd2Q61285 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abcd2Q61285 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abcd2Q61285 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abcd2Q61285 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Abcd2Q61285 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Abcd2Q61285 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Abcd2Q61285 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Abcd2Q61285 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Abcd2Q61285 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Abcd2Q61285 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Abcd2Q61285 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Abcd2Q61285 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Abcd2Q61285 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Abcd2Q61285 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Abcd2Q61285 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Abcd2Q61285 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Abcd2Q61285 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Abcd2Q61285 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Abcd2Q61285 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Abcd2Q61285 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Abcd2Q61285 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Abcd2Q61285 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Abcd2Q61285 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Abcd2Q61285 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Abcd2Q61285 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms