Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cln3Q61124 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cln3Q61124 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cln3Q61124 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cln3Q61124 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cln3Q61124 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cln3Q61124 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cln3Q61124 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cln3Q61124 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cln3Q61124 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cln3Q61124 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cln3Q61124 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cln3Q61124 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cln3Q61124 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cln3Q61124 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cln3Q61124 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cln3Q61124 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cln3Q61124 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cln3Q61124 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cln3Q61124 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cln3Q61124 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cln3Q61124 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cln3Q61124 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cln3Q61124 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cln3Q61124 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cln3Q61124 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cln3Q61124 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cln3Q61124 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cln3Q61124 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cln3Q61124 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cln3Q61124 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cln3Q61124 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cln3Q61124 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cln3Q61124 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cln3Q61124 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cln3Q61124 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cln3Q61124 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cln3Q61124 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cln3Q61124 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cln3Q61124 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cln3Q61124 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cln3Q61124 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cln3Q61124 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cln3Q61124 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cln3Q61124 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cln3Q61124 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cln3Q61124 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cln3Q61124 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cln3Q61124 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cln3Q61124 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cln3Q61124 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cln3Q61124 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cln3Q61124 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cln3Q61124 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cln3Q61124 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cln3Q61124 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cln3Q61124 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cln3Q61124 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cln3Q61124 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cln3Q61124 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cln3Q61124 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cln3Q61124 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cln3Q61124 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cln3Q61124 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cln3Q61124 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cln3Q61124 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cln3Q61124 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cln3Q61124 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cln3Q61124 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cln3Q61124 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cln3Q61124 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cln3Q61124 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cln3Q61124 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cln3Q61124 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cln3Q61124 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cln3Q61124 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cln3Q61124 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cln3Q61124 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cln3Q61124 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cln3Q61124 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cln3Q61124 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cln3Q61124 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cln3Q61124 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cln3Q61124 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cln3Q61124 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cln3Q61124 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cln3Q61124 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cln3Q61124 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cln3Q61124 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cln3Q61124 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cln3Q61124 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cln3Q61124 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cln3Q61124 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cln3Q61124 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cln3Q61124 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cln3Q61124 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cln3Q61124 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cln3Q61124 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cln3Q61124 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cln3Q61124 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.7 ms