Protein–RNA interactions for Protein: Q60715

P4ha1, Prolyl 4-hydroxylase subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4ha1Q60715 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
P4ha1Q60715 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
P4ha1Q60715 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
P4ha1Q60715 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
P4ha1Q60715 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
P4ha1Q60715 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
P4ha1Q60715 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P4ha1Q60715 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
P4ha1Q60715 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
P4ha1Q60715 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P4ha1Q60715 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
P4ha1Q60715 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
P4ha1Q60715 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
P4ha1Q60715 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
P4ha1Q60715 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
P4ha1Q60715 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
P4ha1Q60715 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
P4ha1Q60715 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
P4ha1Q60715 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P4ha1Q60715 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
P4ha1Q60715 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P4ha1Q60715 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P4ha1Q60715 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
P4ha1Q60715 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
P4ha1Q60715 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
P4ha1Q60715 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
P4ha1Q60715 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
P4ha1Q60715 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P4ha1Q60715 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P4ha1Q60715 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
P4ha1Q60715 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
P4ha1Q60715 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
P4ha1Q60715 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
P4ha1Q60715 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
P4ha1Q60715 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
P4ha1Q60715 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
P4ha1Q60715 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
P4ha1Q60715 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
P4ha1Q60715 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
P4ha1Q60715 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
P4ha1Q60715 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
P4ha1Q60715 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
P4ha1Q60715 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
P4ha1Q60715 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P4ha1Q60715 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
P4ha1Q60715 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P4ha1Q60715 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P4ha1Q60715 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P4ha1Q60715 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P4ha1Q60715 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
P4ha1Q60715 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P4ha1Q60715 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
P4ha1Q60715 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P4ha1Q60715 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P4ha1Q60715 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P4ha1Q60715 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
P4ha1Q60715 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P4ha1Q60715 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
P4ha1Q60715 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P4ha1Q60715 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P4ha1Q60715 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P4ha1Q60715 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
P4ha1Q60715 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
P4ha1Q60715 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
P4ha1Q60715 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
P4ha1Q60715 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
P4ha1Q60715 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
P4ha1Q60715 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
P4ha1Q60715 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
P4ha1Q60715 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
P4ha1Q60715 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
P4ha1Q60715 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P4ha1Q60715 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P4ha1Q60715 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P4ha1Q60715 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
P4ha1Q60715 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
P4ha1Q60715 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
P4ha1Q60715 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
P4ha1Q60715 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P4ha1Q60715 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
P4ha1Q60715 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
P4ha1Q60715 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
P4ha1Q60715 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P4ha1Q60715 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P4ha1Q60715 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P4ha1Q60715 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P4ha1Q60715 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P4ha1Q60715 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P4ha1Q60715 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
P4ha1Q60715 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
P4ha1Q60715 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
P4ha1Q60715 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
P4ha1Q60715 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P4ha1Q60715 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P4ha1Q60715 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P4ha1Q60715 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P4ha1Q60715 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
P4ha1Q60715 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P4ha1Q60715 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P4ha1Q60715 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms