Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prdm1Q60636 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prdm1Q60636 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prdm1Q60636 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prdm1Q60636 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prdm1Q60636 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prdm1Q60636 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Prdm1Q60636 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prdm1Q60636 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prdm1Q60636 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prdm1Q60636 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prdm1Q60636 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prdm1Q60636 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prdm1Q60636 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm1Q60636 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm1Q60636 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm1Q60636 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm1Q60636 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm1Q60636 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm1Q60636 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm1Q60636 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm1Q60636 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm1Q60636 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm1Q60636 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm1Q60636 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm1Q60636 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm1Q60636 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm1Q60636 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm1Q60636 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm1Q60636 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm1Q60636 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm1Q60636 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm1Q60636 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm1Q60636 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm1Q60636 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Prdm1Q60636 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prdm1Q60636 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prdm1Q60636 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prdm1Q60636 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prdm1Q60636 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prdm1Q60636 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prdm1Q60636 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prdm1Q60636 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prdm1Q60636 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prdm1Q60636 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prdm1Q60636 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Prdm1Q60636 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prdm1Q60636 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Prdm1Q60636 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prdm1Q60636 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prdm1Q60636 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prdm1Q60636 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prdm1Q60636 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Prdm1Q60636 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prdm1Q60636 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prdm1Q60636 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prdm1Q60636 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prdm1Q60636 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prdm1Q60636 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prdm1Q60636 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prdm1Q60636 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Prdm1Q60636 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prdm1Q60636 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prdm1Q60636 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prdm1Q60636 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prdm1Q60636 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prdm1Q60636 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prdm1Q60636 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prdm1Q60636 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prdm1Q60636 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prdm1Q60636 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prdm1Q60636 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prdm1Q60636 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prdm1Q60636 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prdm1Q60636 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prdm1Q60636 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prdm1Q60636 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prdm1Q60636 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prdm1Q60636 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prdm1Q60636 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prdm1Q60636 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prdm1Q60636 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prdm1Q60636 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prdm1Q60636 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Prdm1Q60636 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prdm1Q60636 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prdm1Q60636 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prdm1Q60636 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prdm1Q60636 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Prdm1Q60636 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Prdm1Q60636 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Prdm1Q60636 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prdm1Q60636 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prdm1Q60636 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Prdm1Q60636 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prdm1Q60636 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prdm1Q60636 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prdm1Q60636 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prdm1Q60636 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prdm1Q60636 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.5 ms