Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc125Q5U465 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc125Q5U465 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc125Q5U465 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc125Q5U465 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc125Q5U465 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc125Q5U465 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc125Q5U465 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc125Q5U465 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc125Q5U465 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc125Q5U465 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc125Q5U465 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc125Q5U465 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc125Q5U465 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc125Q5U465 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc125Q5U465 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc125Q5U465 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc125Q5U465 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc125Q5U465 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc125Q5U465 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc125Q5U465 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc125Q5U465 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc125Q5U465 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc125Q5U465 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc125Q5U465 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc125Q5U465 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc125Q5U465 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc125Q5U465 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc125Q5U465 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc125Q5U465 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc125Q5U465 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc125Q5U465 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc125Q5U465 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc125Q5U465 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc125Q5U465 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc125Q5U465 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc125Q5U465 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc125Q5U465 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc125Q5U465 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc125Q5U465 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc125Q5U465 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc125Q5U465 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc125Q5U465 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc125Q5U465 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc125Q5U465 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc125Q5U465 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccdc125Q5U465 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc125Q5U465 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc125Q5U465 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc125Q5U465 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc125Q5U465 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc125Q5U465 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc125Q5U465 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc125Q5U465 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc125Q5U465 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc125Q5U465 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc125Q5U465 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc125Q5U465 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc125Q5U465 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc125Q5U465 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc125Q5U465 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc125Q5U465 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc125Q5U465 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc125Q5U465 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc125Q5U465 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc125Q5U465 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc125Q5U465 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc125Q5U465 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc125Q5U465 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc125Q5U465 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc125Q5U465 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc125Q5U465 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc125Q5U465 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc125Q5U465 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc125Q5U465 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc125Q5U465 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc125Q5U465 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc125Q5U465 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc125Q5U465 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc125Q5U465 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc125Q5U465 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc125Q5U465 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc125Q5U465 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc125Q5U465 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc125Q5U465 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc125Q5U465 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc125Q5U465 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc125Q5U465 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc125Q5U465 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc125Q5U465 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc125Q5U465 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc125Q5U465 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc125Q5U465 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc125Q5U465 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc125Q5U465 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc125Q5U465 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc125Q5U465 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc125Q5U465 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc125Q5U465 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc125Q5U465 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms