Protein–RNA interactions for Protein: Q5U452

Trp53rka, MCG14616, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53rkaQ5U452 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trp53rkaQ5U452 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trp53rkaQ5U452 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trp53rkaQ5U452 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trp53rkaQ5U452 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trp53rkaQ5U452 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trp53rkaQ5U452 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trp53rkaQ5U452 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trp53rkaQ5U452 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trp53rkaQ5U452 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trp53rkaQ5U452 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trp53rkaQ5U452 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trp53rkaQ5U452 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trp53rkaQ5U452 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trp53rkaQ5U452 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trp53rkaQ5U452 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trp53rkaQ5U452 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trp53rkaQ5U452 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trp53rkaQ5U452 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trp53rkaQ5U452 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trp53rkaQ5U452 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trp53rkaQ5U452 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trp53rkaQ5U452 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trp53rkaQ5U452 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trp53rkaQ5U452 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trp53rkaQ5U452 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trp53rkaQ5U452 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trp53rkaQ5U452 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trp53rkaQ5U452 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trp53rkaQ5U452 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trp53rkaQ5U452 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trp53rkaQ5U452 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trp53rkaQ5U452 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trp53rkaQ5U452 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trp53rkaQ5U452 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trp53rkaQ5U452 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trp53rkaQ5U452 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trp53rkaQ5U452 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trp53rkaQ5U452 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trp53rkaQ5U452 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trp53rkaQ5U452 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trp53rkaQ5U452 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trp53rkaQ5U452 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trp53rkaQ5U452 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trp53rkaQ5U452 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trp53rkaQ5U452 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trp53rkaQ5U452 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trp53rkaQ5U452 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trp53rkaQ5U452 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trp53rkaQ5U452 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trp53rkaQ5U452 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trp53rkaQ5U452 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trp53rkaQ5U452 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trp53rkaQ5U452 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trp53rkaQ5U452 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trp53rkaQ5U452 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trp53rkaQ5U452 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trp53rkaQ5U452 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trp53rkaQ5U452 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trp53rkaQ5U452 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trp53rkaQ5U452 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trp53rkaQ5U452 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trp53rkaQ5U452 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trp53rkaQ5U452 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trp53rkaQ5U452 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trp53rkaQ5U452 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trp53rkaQ5U452 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trp53rkaQ5U452 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trp53rkaQ5U452 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trp53rkaQ5U452 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trp53rkaQ5U452 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trp53rkaQ5U452 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trp53rkaQ5U452 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trp53rkaQ5U452 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trp53rkaQ5U452 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trp53rkaQ5U452 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trp53rkaQ5U452 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trp53rkaQ5U452 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trp53rkaQ5U452 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trp53rkaQ5U452 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trp53rkaQ5U452 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trp53rkaQ5U452 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trp53rkaQ5U452 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trp53rkaQ5U452 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trp53rkaQ5U452 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trp53rkaQ5U452 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trp53rkaQ5U452 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trp53rkaQ5U452 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trp53rkaQ5U452 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trp53rkaQ5U452 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trp53rkaQ5U452 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trp53rkaQ5U452 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trp53rkaQ5U452 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trp53rkaQ5U452 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trp53rkaQ5U452 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trp53rkaQ5U452 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trp53rkaQ5U452 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trp53rkaQ5U452 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trp53rkaQ5U452 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trp53rkaQ5U452 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.7 ms