Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bbs12Q5SUD9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Bbs12Q5SUD9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms