Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Psme4Q5SSW2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Psme4Q5SSW2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Psme4Q5SSW2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Psme4Q5SSW2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Psme4Q5SSW2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Psme4Q5SSW2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Psme4Q5SSW2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Psme4Q5SSW2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Psme4Q5SSW2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Psme4Q5SSW2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Psme4Q5SSW2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Psme4Q5SSW2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Psme4Q5SSW2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Psme4Q5SSW2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Psme4Q5SSW2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Psme4Q5SSW2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Psme4Q5SSW2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Psme4Q5SSW2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Psme4Q5SSW2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Psme4Q5SSW2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Psme4Q5SSW2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Psme4Q5SSW2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Psme4Q5SSW2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Psme4Q5SSW2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Psme4Q5SSW2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Psme4Q5SSW2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Psme4Q5SSW2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Psme4Q5SSW2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Psme4Q5SSW2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Psme4Q5SSW2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Psme4Q5SSW2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Psme4Q5SSW2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Psme4Q5SSW2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Psme4Q5SSW2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Psme4Q5SSW2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Psme4Q5SSW2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Psme4Q5SSW2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Psme4Q5SSW2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Psme4Q5SSW2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Psme4Q5SSW2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Psme4Q5SSW2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Psme4Q5SSW2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Psme4Q5SSW2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Psme4Q5SSW2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Psme4Q5SSW2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Psme4Q5SSW2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Psme4Q5SSW2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Psme4Q5SSW2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Psme4Q5SSW2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Psme4Q5SSW2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Psme4Q5SSW2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Psme4Q5SSW2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Psme4Q5SSW2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Psme4Q5SSW2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Psme4Q5SSW2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Psme4Q5SSW2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Psme4Q5SSW2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Psme4Q5SSW2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Psme4Q5SSW2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Psme4Q5SSW2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Psme4Q5SSW2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Psme4Q5SSW2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Psme4Q5SSW2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Psme4Q5SSW2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Psme4Q5SSW2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Psme4Q5SSW2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Psme4Q5SSW2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Psme4Q5SSW2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Psme4Q5SSW2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Psme4Q5SSW2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Psme4Q5SSW2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Psme4Q5SSW2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Psme4Q5SSW2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Psme4Q5SSW2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Psme4Q5SSW2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Psme4Q5SSW2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Psme4Q5SSW2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Psme4Q5SSW2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Psme4Q5SSW2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Psme4Q5SSW2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Psme4Q5SSW2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Psme4Q5SSW2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Psme4Q5SSW2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Psme4Q5SSW2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Psme4Q5SSW2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Psme4Q5SSW2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Psme4Q5SSW2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Psme4Q5SSW2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Psme4Q5SSW2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Psme4Q5SSW2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Psme4Q5SSW2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Psme4Q5SSW2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Psme4Q5SSW2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Psme4Q5SSW2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Psme4Q5SSW2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Psme4Q5SSW2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Psme4Q5SSW2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Psme4Q5SSW2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Psme4Q5SSW2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms