Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD0

WASHC2D, WASH complex subunit 2D, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2DQ5SRD0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms