Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc88aQ5SNZ0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc88aQ5SNZ0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc88aQ5SNZ0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc88aQ5SNZ0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc88aQ5SNZ0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc88aQ5SNZ0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc88aQ5SNZ0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms