Protein–RNA interactions for Protein: Q4FK66

Prpf38a, Pre-mRNA-splicing factor 38A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf38aQ4FK66 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prpf38aQ4FK66 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prpf38aQ4FK66 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prpf38aQ4FK66 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prpf38aQ4FK66 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prpf38aQ4FK66 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prpf38aQ4FK66 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prpf38aQ4FK66 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prpf38aQ4FK66 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prpf38aQ4FK66 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Prpf38aQ4FK66 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prpf38aQ4FK66 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prpf38aQ4FK66 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prpf38aQ4FK66 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prpf38aQ4FK66 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prpf38aQ4FK66 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prpf38aQ4FK66 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prpf38aQ4FK66 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prpf38aQ4FK66 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prpf38aQ4FK66 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Prpf38aQ4FK66 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prpf38aQ4FK66 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prpf38aQ4FK66 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prpf38aQ4FK66 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prpf38aQ4FK66 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Prpf38aQ4FK66 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Prpf38aQ4FK66 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Prpf38aQ4FK66 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Prpf38aQ4FK66 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prpf38aQ4FK66 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prpf38aQ4FK66 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prpf38aQ4FK66 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Prpf38aQ4FK66 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prpf38aQ4FK66 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prpf38aQ4FK66 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prpf38aQ4FK66 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prpf38aQ4FK66 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prpf38aQ4FK66 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Prpf38aQ4FK66 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Prpf38aQ4FK66 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prpf38aQ4FK66 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prpf38aQ4FK66 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prpf38aQ4FK66 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prpf38aQ4FK66 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prpf38aQ4FK66 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prpf38aQ4FK66 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prpf38aQ4FK66 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prpf38aQ4FK66 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prpf38aQ4FK66 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prpf38aQ4FK66 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prpf38aQ4FK66 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prpf38aQ4FK66 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prpf38aQ4FK66 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prpf38aQ4FK66 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prpf38aQ4FK66 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prpf38aQ4FK66 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Prpf38aQ4FK66 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prpf38aQ4FK66 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prpf38aQ4FK66 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prpf38aQ4FK66 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Prpf38aQ4FK66 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prpf38aQ4FK66 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prpf38aQ4FK66 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prpf38aQ4FK66 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Prpf38aQ4FK66 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prpf38aQ4FK66 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prpf38aQ4FK66 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prpf38aQ4FK66 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prpf38aQ4FK66 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prpf38aQ4FK66 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prpf38aQ4FK66 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prpf38aQ4FK66 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prpf38aQ4FK66 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prpf38aQ4FK66 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prpf38aQ4FK66 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prpf38aQ4FK66 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prpf38aQ4FK66 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prpf38aQ4FK66 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Prpf38aQ4FK66 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prpf38aQ4FK66 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prpf38aQ4FK66 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prpf38aQ4FK66 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prpf38aQ4FK66 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prpf38aQ4FK66 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prpf38aQ4FK66 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prpf38aQ4FK66 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prpf38aQ4FK66 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prpf38aQ4FK66 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prpf38aQ4FK66 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prpf38aQ4FK66 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prpf38aQ4FK66 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Prpf38aQ4FK66 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prpf38aQ4FK66 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prpf38aQ4FK66 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prpf38aQ4FK66 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prpf38aQ4FK66 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prpf38aQ4FK66 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prpf38aQ4FK66 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prpf38aQ4FK66 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prpf38aQ4FK66 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms