Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Carmil2Q3V3V9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Carmil2Q3V3V9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Carmil2Q3V3V9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Carmil2Q3V3V9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Carmil2Q3V3V9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Carmil2Q3V3V9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Carmil2Q3V3V9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Carmil2Q3V3V9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Carmil2Q3V3V9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Carmil2Q3V3V9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Carmil2Q3V3V9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Carmil2Q3V3V9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Carmil2Q3V3V9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Carmil2Q3V3V9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Carmil2Q3V3V9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Carmil2Q3V3V9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Carmil2Q3V3V9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Carmil2Q3V3V9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Carmil2Q3V3V9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Carmil2Q3V3V9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Carmil2Q3V3V9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Carmil2Q3V3V9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Carmil2Q3V3V9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Carmil2Q3V3V9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Carmil2Q3V3V9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Carmil2Q3V3V9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Carmil2Q3V3V9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Carmil2Q3V3V9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Carmil2Q3V3V9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Carmil2Q3V3V9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Carmil2Q3V3V9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Carmil2Q3V3V9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Carmil2Q3V3V9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Carmil2Q3V3V9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Carmil2Q3V3V9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Carmil2Q3V3V9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Carmil2Q3V3V9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Carmil2Q3V3V9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Carmil2Q3V3V9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Carmil2Q3V3V9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Carmil2Q3V3V9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Carmil2Q3V3V9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Carmil2Q3V3V9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Carmil2Q3V3V9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Carmil2Q3V3V9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Carmil2Q3V3V9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Carmil2Q3V3V9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Carmil2Q3V3V9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Carmil2Q3V3V9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Carmil2Q3V3V9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Carmil2Q3V3V9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Carmil2Q3V3V9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Carmil2Q3V3V9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Carmil2Q3V3V9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Carmil2Q3V3V9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Carmil2Q3V3V9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Carmil2Q3V3V9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Carmil2Q3V3V9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Carmil2Q3V3V9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Carmil2Q3V3V9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Carmil2Q3V3V9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Carmil2Q3V3V9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Carmil2Q3V3V9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Carmil2Q3V3V9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Carmil2Q3V3V9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Carmil2Q3V3V9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Carmil2Q3V3V9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Carmil2Q3V3V9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Carmil2Q3V3V9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Carmil2Q3V3V9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Carmil2Q3V3V9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Carmil2Q3V3V9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Carmil2Q3V3V9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Carmil2Q3V3V9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Carmil2Q3V3V9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Carmil2Q3V3V9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Carmil2Q3V3V9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Carmil2Q3V3V9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Carmil2Q3V3V9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Carmil2Q3V3V9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Carmil2Q3V3V9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Carmil2Q3V3V9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Carmil2Q3V3V9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Carmil2Q3V3V9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Carmil2Q3V3V9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Carmil2Q3V3V9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Carmil2Q3V3V9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Carmil2Q3V3V9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Carmil2Q3V3V9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Carmil2Q3V3V9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Carmil2Q3V3V9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Carmil2Q3V3V9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Carmil2Q3V3V9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Carmil2Q3V3V9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Carmil2Q3V3V9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Carmil2Q3V3V9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Carmil2Q3V3V9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Carmil2Q3V3V9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Carmil2Q3V3V9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms