Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1V3

Esf1, ESF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Esf1Q3V1V3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Esf1Q3V1V3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Esf1Q3V1V3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Esf1Q3V1V3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Esf1Q3V1V3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Esf1Q3V1V3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Esf1Q3V1V3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Esf1Q3V1V3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Esf1Q3V1V3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Esf1Q3V1V3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Esf1Q3V1V3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Esf1Q3V1V3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Esf1Q3V1V3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Esf1Q3V1V3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Esf1Q3V1V3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Esf1Q3V1V3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Esf1Q3V1V3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Esf1Q3V1V3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Esf1Q3V1V3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Esf1Q3V1V3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Esf1Q3V1V3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
Esf1Q3V1V3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Esf1Q3V1V3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Esf1Q3V1V3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Esf1Q3V1V3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Esf1Q3V1V3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Esf1Q3V1V3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Esf1Q3V1V3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Esf1Q3V1V3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Esf1Q3V1V3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Esf1Q3V1V3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Esf1Q3V1V3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Esf1Q3V1V3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Esf1Q3V1V3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Esf1Q3V1V3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
Esf1Q3V1V3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Esf1Q3V1V3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Esf1Q3V1V3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Esf1Q3V1V3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Esf1Q3V1V3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Esf1Q3V1V3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Esf1Q3V1V3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Esf1Q3V1V3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Esf1Q3V1V3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
Esf1Q3V1V3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Esf1Q3V1V3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Esf1Q3V1V3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Esf1Q3V1V3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Esf1Q3V1V3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
Esf1Q3V1V3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Esf1Q3V1V3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Esf1Q3V1V3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Esf1Q3V1V3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC34.45■■■■□ 3.1
Esf1Q3V1V3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Esf1Q3V1V3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Esf1Q3V1V3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Esf1Q3V1V3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Esf1Q3V1V3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Esf1Q3V1V3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Esf1Q3V1V3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Esf1Q3V1V3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Esf1Q3V1V3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Esf1Q3V1V3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
Esf1Q3V1V3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Esf1Q3V1V3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Esf1Q3V1V3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Esf1Q3V1V3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Esf1Q3V1V3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Esf1Q3V1V3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
Esf1Q3V1V3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
Esf1Q3V1V3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Esf1Q3V1V3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Esf1Q3V1V3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Esf1Q3V1V3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Esf1Q3V1V3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Esf1Q3V1V3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Esf1Q3V1V3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Esf1Q3V1V3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Esf1Q3V1V3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Esf1Q3V1V3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Esf1Q3V1V3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Esf1Q3V1V3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Esf1Q3V1V3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Esf1Q3V1V3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Esf1Q3V1V3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Esf1Q3V1V3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Esf1Q3V1V3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Esf1Q3V1V3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Esf1Q3V1V3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Esf1Q3V1V3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Esf1Q3V1V3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Esf1Q3V1V3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Esf1Q3V1V3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Esf1Q3V1V3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Esf1Q3V1V3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Esf1Q3V1V3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Esf1Q3V1V3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Esf1Q3V1V3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Esf1Q3V1V3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Esf1Q3V1V3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms