Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc27Q3V036 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc27Q3V036 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc27Q3V036 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc27Q3V036 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc27Q3V036 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc27Q3V036 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc27Q3V036 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc27Q3V036 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc27Q3V036 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc27Q3V036 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc27Q3V036 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc27Q3V036 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc27Q3V036 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc27Q3V036 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc27Q3V036 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc27Q3V036 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc27Q3V036 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc27Q3V036 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc27Q3V036 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc27Q3V036 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc27Q3V036 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc27Q3V036 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc27Q3V036 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc27Q3V036 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc27Q3V036 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc27Q3V036 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc27Q3V036 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc27Q3V036 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc27Q3V036 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc27Q3V036 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc27Q3V036 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc27Q3V036 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc27Q3V036 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc27Q3V036 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc27Q3V036 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc27Q3V036 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc27Q3V036 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc27Q3V036 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc27Q3V036 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc27Q3V036 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc27Q3V036 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc27Q3V036 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc27Q3V036 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc27Q3V036 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc27Q3V036 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc27Q3V036 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc27Q3V036 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc27Q3V036 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc27Q3V036 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc27Q3V036 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc27Q3V036 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc27Q3V036 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc27Q3V036 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc27Q3V036 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc27Q3V036 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc27Q3V036 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc27Q3V036 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc27Q3V036 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc27Q3V036 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc27Q3V036 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc27Q3V036 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc27Q3V036 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc27Q3V036 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc27Q3V036 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc27Q3V036 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc27Q3V036 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc27Q3V036 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc27Q3V036 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc27Q3V036 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc27Q3V036 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc27Q3V036 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc27Q3V036 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc27Q3V036 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc27Q3V036 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc27Q3V036 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc27Q3V036 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc27Q3V036 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc27Q3V036 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc27Q3V036 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc27Q3V036 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc27Q3V036 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc27Q3V036 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc27Q3V036 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc27Q3V036 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc27Q3V036 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc27Q3V036 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc27Q3V036 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc27Q3V036 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc27Q3V036 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc27Q3V036 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc27Q3V036 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc27Q3V036 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc27Q3V036 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc27Q3V036 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc27Q3V036 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc27Q3V036 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc27Q3V036 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc27Q3V036 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc27Q3V036 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.6 ms