Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnpc3Q3UZ01 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnpc3Q3UZ01 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnpc3Q3UZ01 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnpc3Q3UZ01 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnpc3Q3UZ01 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnpc3Q3UZ01 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rnpc3Q3UZ01 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Rnpc3Q3UZ01 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnpc3Q3UZ01 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnpc3Q3UZ01 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnpc3Q3UZ01 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnpc3Q3UZ01 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnpc3Q3UZ01 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnpc3Q3UZ01 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnpc3Q3UZ01 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnpc3Q3UZ01 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnpc3Q3UZ01 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnpc3Q3UZ01 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnpc3Q3UZ01 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnpc3Q3UZ01 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnpc3Q3UZ01 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnpc3Q3UZ01 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnpc3Q3UZ01 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnpc3Q3UZ01 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnpc3Q3UZ01 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnpc3Q3UZ01 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnpc3Q3UZ01 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnpc3Q3UZ01 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnpc3Q3UZ01 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnpc3Q3UZ01 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnpc3Q3UZ01 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnpc3Q3UZ01 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnpc3Q3UZ01 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnpc3Q3UZ01 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnpc3Q3UZ01 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnpc3Q3UZ01 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnpc3Q3UZ01 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnpc3Q3UZ01 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnpc3Q3UZ01 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnpc3Q3UZ01 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnpc3Q3UZ01 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnpc3Q3UZ01 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnpc3Q3UZ01 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnpc3Q3UZ01 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnpc3Q3UZ01 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnpc3Q3UZ01 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnpc3Q3UZ01 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnpc3Q3UZ01 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnpc3Q3UZ01 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnpc3Q3UZ01 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnpc3Q3UZ01 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnpc3Q3UZ01 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnpc3Q3UZ01 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnpc3Q3UZ01 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnpc3Q3UZ01 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnpc3Q3UZ01 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnpc3Q3UZ01 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnpc3Q3UZ01 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnpc3Q3UZ01 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnpc3Q3UZ01 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnpc3Q3UZ01 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnpc3Q3UZ01 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnpc3Q3UZ01 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rnpc3Q3UZ01 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rnpc3Q3UZ01 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnpc3Q3UZ01 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnpc3Q3UZ01 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnpc3Q3UZ01 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnpc3Q3UZ01 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnpc3Q3UZ01 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnpc3Q3UZ01 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnpc3Q3UZ01 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnpc3Q3UZ01 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnpc3Q3UZ01 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnpc3Q3UZ01 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnpc3Q3UZ01 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnpc3Q3UZ01 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnpc3Q3UZ01 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnpc3Q3UZ01 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnpc3Q3UZ01 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnpc3Q3UZ01 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnpc3Q3UZ01 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnpc3Q3UZ01 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnpc3Q3UZ01 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnpc3Q3UZ01 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnpc3Q3UZ01 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnpc3Q3UZ01 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnpc3Q3UZ01 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnpc3Q3UZ01 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnpc3Q3UZ01 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnpc3Q3UZ01 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnpc3Q3UZ01 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnpc3Q3UZ01 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnpc3Q3UZ01 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnpc3Q3UZ01 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnpc3Q3UZ01 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnpc3Q3UZ01 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnpc3Q3UZ01 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms