Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX49

C87499, Expressed sequence C87499, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87499Q3UX49 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C87499Q3UX49 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C87499Q3UX49 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C87499Q3UX49 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C87499Q3UX49 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C87499Q3UX49 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C87499Q3UX49 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C87499Q3UX49 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
C87499Q3UX49 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C87499Q3UX49 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C87499Q3UX49 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C87499Q3UX49 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C87499Q3UX49 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
C87499Q3UX49 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C87499Q3UX49 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C87499Q3UX49 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C87499Q3UX49 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C87499Q3UX49 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C87499Q3UX49 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C87499Q3UX49 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C87499Q3UX49 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C87499Q3UX49 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C87499Q3UX49 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C87499Q3UX49 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
C87499Q3UX49 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C87499Q3UX49 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C87499Q3UX49 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C87499Q3UX49 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C87499Q3UX49 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C87499Q3UX49 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C87499Q3UX49 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C87499Q3UX49 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C87499Q3UX49 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
C87499Q3UX49 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
C87499Q3UX49 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C87499Q3UX49 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C87499Q3UX49 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C87499Q3UX49 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C87499Q3UX49 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C87499Q3UX49 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C87499Q3UX49 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C87499Q3UX49 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C87499Q3UX49 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C87499Q3UX49 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C87499Q3UX49 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C87499Q3UX49 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C87499Q3UX49 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C87499Q3UX49 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C87499Q3UX49 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C87499Q3UX49 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C87499Q3UX49 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C87499Q3UX49 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C87499Q3UX49 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C87499Q3UX49 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C87499Q3UX49 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C87499Q3UX49 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C87499Q3UX49 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C87499Q3UX49 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C87499Q3UX49 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C87499Q3UX49 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C87499Q3UX49 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C87499Q3UX49 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C87499Q3UX49 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C87499Q3UX49 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C87499Q3UX49 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C87499Q3UX49 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C87499Q3UX49 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C87499Q3UX49 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C87499Q3UX49 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C87499Q3UX49 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C87499Q3UX49 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C87499Q3UX49 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C87499Q3UX49 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C87499Q3UX49 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C87499Q3UX49 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C87499Q3UX49 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C87499Q3UX49 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C87499Q3UX49 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
C87499Q3UX49 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C87499Q3UX49 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C87499Q3UX49 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C87499Q3UX49 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C87499Q3UX49 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C87499Q3UX49 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C87499Q3UX49 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C87499Q3UX49 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C87499Q3UX49 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C87499Q3UX49 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C87499Q3UX49 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C87499Q3UX49 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C87499Q3UX49 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C87499Q3UX49 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C87499Q3UX49 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C87499Q3UX49 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C87499Q3UX49 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C87499Q3UX49 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C87499Q3UX49 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C87499Q3UX49 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C87499Q3UX49 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C87499Q3UX49 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89 ms