Protein–RNA interactions for Protein: Q3URJ8

Nkain3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain3Q3URJ8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nkain3Q3URJ8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nkain3Q3URJ8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nkain3Q3URJ8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nkain3Q3URJ8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nkain3Q3URJ8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nkain3Q3URJ8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nkain3Q3URJ8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nkain3Q3URJ8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nkain3Q3URJ8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nkain3Q3URJ8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nkain3Q3URJ8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nkain3Q3URJ8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nkain3Q3URJ8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nkain3Q3URJ8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nkain3Q3URJ8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nkain3Q3URJ8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nkain3Q3URJ8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nkain3Q3URJ8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms