Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ulk3Q3U3Q1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ulk3Q3U3Q1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ulk3Q3U3Q1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ulk3Q3U3Q1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ulk3Q3U3Q1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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Ulk3Q3U3Q1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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Ulk3Q3U3Q1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ulk3Q3U3Q1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ulk3Q3U3Q1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ulk3Q3U3Q1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ulk3Q3U3Q1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ulk3Q3U3Q1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ulk3Q3U3Q1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ulk3Q3U3Q1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ulk3Q3U3Q1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ulk3Q3U3Q1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ulk3Q3U3Q1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ulk3Q3U3Q1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ulk3Q3U3Q1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ulk3Q3U3Q1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ulk3Q3U3Q1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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