Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQ03

Ciart, Circadian-associated transcriptional repressor, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiartQ3TQ03 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CiartQ3TQ03 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CiartQ3TQ03 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CiartQ3TQ03 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CiartQ3TQ03 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CiartQ3TQ03 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CiartQ3TQ03 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CiartQ3TQ03 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CiartQ3TQ03 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CiartQ3TQ03 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CiartQ3TQ03 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CiartQ3TQ03 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CiartQ3TQ03 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CiartQ3TQ03 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CiartQ3TQ03 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CiartQ3TQ03 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CiartQ3TQ03 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CiartQ3TQ03 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CiartQ3TQ03 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CiartQ3TQ03 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CiartQ3TQ03 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CiartQ3TQ03 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CiartQ3TQ03 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CiartQ3TQ03 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CiartQ3TQ03 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CiartQ3TQ03 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CiartQ3TQ03 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CiartQ3TQ03 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CiartQ3TQ03 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CiartQ3TQ03 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CiartQ3TQ03 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CiartQ3TQ03 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CiartQ3TQ03 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CiartQ3TQ03 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CiartQ3TQ03 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CiartQ3TQ03 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CiartQ3TQ03 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CiartQ3TQ03 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CiartQ3TQ03 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CiartQ3TQ03 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CiartQ3TQ03 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CiartQ3TQ03 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CiartQ3TQ03 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CiartQ3TQ03 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CiartQ3TQ03 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CiartQ3TQ03 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CiartQ3TQ03 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CiartQ3TQ03 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CiartQ3TQ03 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CiartQ3TQ03 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CiartQ3TQ03 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CiartQ3TQ03 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CiartQ3TQ03 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CiartQ3TQ03 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CiartQ3TQ03 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CiartQ3TQ03 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CiartQ3TQ03 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CiartQ3TQ03 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CiartQ3TQ03 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CiartQ3TQ03 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CiartQ3TQ03 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CiartQ3TQ03 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CiartQ3TQ03 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CiartQ3TQ03 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CiartQ3TQ03 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CiartQ3TQ03 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CiartQ3TQ03 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CiartQ3TQ03 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CiartQ3TQ03 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CiartQ3TQ03 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CiartQ3TQ03 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CiartQ3TQ03 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CiartQ3TQ03 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CiartQ3TQ03 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CiartQ3TQ03 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CiartQ3TQ03 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CiartQ3TQ03 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CiartQ3TQ03 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CiartQ3TQ03 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CiartQ3TQ03 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CiartQ3TQ03 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CiartQ3TQ03 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CiartQ3TQ03 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CiartQ3TQ03 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CiartQ3TQ03 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CiartQ3TQ03 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CiartQ3TQ03 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CiartQ3TQ03 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CiartQ3TQ03 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CiartQ3TQ03 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CiartQ3TQ03 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CiartQ3TQ03 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CiartQ3TQ03 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CiartQ3TQ03 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CiartQ3TQ03 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CiartQ3TQ03 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CiartQ3TQ03 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CiartQ3TQ03 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CiartQ3TQ03 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CiartQ3TQ03 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms